22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2435 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  64.37 
 
 
1307 aa  1731    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  47.07 
 
 
1090 aa  788    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  41.97 
 
 
1481 aa  1103    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  43.55 
 
 
1222 aa  789    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  44.46 
 
 
1373 aa  1145    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  44.77 
 
 
1193 aa  793    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  43.8 
 
 
1366 aa  1134    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  65.24 
 
 
1283 aa  1747    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  42.75 
 
 
1131 aa  718    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  53.31 
 
 
1146 aa  931    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  42.2 
 
 
1131 aa  716    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  38.67 
 
 
1665 aa  725    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  42.81 
 
 
1131 aa  709    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  42.09 
 
 
1131 aa  714    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  65.37 
 
 
1285 aa  1733    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  57.59 
 
 
1141 aa  1030    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  53.62 
 
 
1109 aa  912    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  52.3 
 
 
1185 aa  944    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  100 
 
 
1286 aa  2649    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  38.48 
 
 
1125 aa  596  1e-168  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1040  MCM family protein  30.56 
 
 
873 aa  60.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.304437  normal  0.0782008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0687  hypothetical protein  34.21 
 
 
502 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>