20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1794 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  36.99 
 
 		 1146 aa  771    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  37.68 
 
 		 1185 aa  801    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  38.9 
 
 		 1109 aa  811    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  36.66 
 
 		 1141 aa  739    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  40.45 
 
 		 1090 aa  803    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  38.19 
 
 		 1131 aa  800    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  37.67 
 
 		 1131 aa  778    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  37.55 
 
 		 1131 aa  785    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  33.77 
 
 		 1222 aa  739    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  37.59 
 
 		 1131 aa  787    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  100 
 
 		 1125 aa  2319    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  33.72 
 
 		 1193 aa  705    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  37.9 
 
 		 1665 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  37.82 
 
 		 1286 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  37.05 
 
 		 1283 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  35.71 
 
 		 1285 aa  566  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  35.75 
 
 		 1307 aa  550  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  32.55 
 
 		 1373 aa  531  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  32.94 
 
 		 1366 aa  525  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  35.8 
 
 		 1481 aa  248  6.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>