34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1141 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  38.56 
 
 		 1286 aa  707    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  44.49 
 
 		 1090 aa  743    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  38.06 
 
 		 1481 aa  731    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  40.12 
 
 		 1222 aa  721    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  39.77 
 
 		 1373 aa  728    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  40.31 
 
 		 1193 aa  709    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  37.73 
 
 		 1366 aa  744    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  39.58 
 
 		 1283 aa  735    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  70.35 
 
 		 1131 aa  1300    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  38.43 
 
 		 1307 aa  722    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  69.8 
 
 		 1131 aa  1297    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  100 
 
 		 1665 aa  3402    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  70.24 
 
 		 1131 aa  1306    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  69.58 
 
 		 1131 aa  1293    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  42.9 
 
 		 1146 aa  722    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  38.37 
 
 		 1285 aa  725    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  43.24 
 
 		 1185 aa  738    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  41.95 
 
 		 1109 aa  717    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  38.15 
 
 		 1141 aa  669    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  38.4 
 
 		 1125 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  25.9 
 
 		 906 aa  82.8  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0697467  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2749  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.34 
 
 		 772 aa  69.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.982206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2104  MCM family protein  26.6 
 
 		 1064 aa  62.4  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.285341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0781  RNA polymerase Rpb1 domain 5  22.85 
 
 		 907 aa  55.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0893602  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1247  MCM family protein  26.67 
 
 		 1059 aa  53.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2167  transcriptional regulator, XRE family  22.18 
 
 		 1412 aa  54.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4372  XRE family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 1188 aa  52.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00730956  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  24.55 
 
 		 898 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  23.36 
 
 		 1531 aa  50.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1071  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  28.03 
 
 		 1197 aa  49.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00208711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0442  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  24.62 
 
 		 955 aa  49.3  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  24.82 
 
 		 1272 aa  48.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  20.75 
 
 		 1273 aa  47.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2478  protein splicing site  23.05 
 
 		 1080 aa  45.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242027  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>