20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0899 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  51.78 
 
 		 1307 aa  885    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  49.47 
 
 		 1090 aa  1085    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  49.3 
 
 		 1222 aa  1196    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  47.7 
 
 		 1373 aa  882    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  49.66 
 
 		 1193 aa  1181    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  47.55 
 
 		 1366 aa  862    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  52.59 
 
 		 1283 aa  906    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  37.32 
 
 		 1125 aa  753    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  46.26 
 
 		 1131 aa  1021    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  100 
 
 		 1146 aa  2348    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  46.01 
 
 		 1131 aa  1013    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  43.11 
 
 		 1665 aa  719    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  46.55 
 
 		 1131 aa  1020    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  46.3 
 
 		 1131 aa  1016    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  53.76 
 
 		 1285 aa  919    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  50.52 
 
 		 1141 aa  1119    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  58 
 
 		 1109 aa  1326    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  68.67 
 
 		 1185 aa  1645    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  53.31 
 
 		 1286 aa  923    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  47.08 
 
 		 1481 aa  555  1e-156  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>