21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1172 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0126  DNA polymerase II large subunit  46.42 
 
 		 1307 aa  770    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1172  DNA polymerase II, large subunit DP2  100 
 
 		 1090 aa  2221    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3690  DNA polymerase II, large subunit DP2  42.1 
 
 		 1222 aa  954    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0763  DNA polymerase II, large subunit DP2  40.02 
 
 		 1373 aa  707    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.107961  normal  0.449591 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1619  DNA polymerase II large subunit  41.93 
 
 		 1193 aa  956    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.710974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0150  DNA polymerase II large subunit  40.41 
 
 		 1366 aa  707    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2254  DNA polymerase II large subunit  45.79 
 
 		 1283 aa  755    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.413677 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1794  DNA polymerase II large subunit  40.67 
 
 		 1125 aa  786    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0923  DNA polymerase II large subunit  47.4 
 
 		 1131 aa  1015    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0899  DNA polymerase II large subunit  49.47 
 
 		 1146 aa  1077    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1023  DNA polymerase II large subunit  47.22 
 
 		 1131 aa  1016    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.770996 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  44.49 
 
 		 1665 aa  740    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1196  DNA polymerase II large subunit  45.98 
 
 		 1131 aa  994    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1656  DNA polymerase II large subunit  46.21 
 
 		 1131 aa  1003    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2124  DNA polymerase II large subunit  46.55 
 
 		 1285 aa  759    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1699  DNA polymerase II large subunit  47.89 
 
 		 1141 aa  1034    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.672511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1250  DNA polymerase II large subunit  49.5 
 
 		 1109 aa  1088    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2423  DNA polymerase II large subunit  50.26 
 
 		 1185 aa  1109    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2435  DNA polymerase II large subunit  47.07 
 
 		 1286 aa  768    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1995  DNA polymerase II, large subunit DP2  43.62 
 
 		 1481 aa  291  6e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  27.04 
 
 		 823 aa  47  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>