201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1381 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  100 
 
 		 898 aa  1857    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  63.91 
 
 		 775 aa  614  9.999999999999999e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  95.7 
 
 		 507 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  71.53 
 
 		 500 aa  455  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  61.01 
 
 		 499 aa  352  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  59.71 
 
 		 495 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  59.14 
 
 		 499 aa  342  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  59.14 
 
 		 499 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  59.14 
 
 		 499 aa  342  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  55.74 
 
 		 513 aa  332  3e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  45.02 
 
 		 467 aa  254  4.0000000000000004e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  39.93 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  39.44 
 
 		 485 aa  191  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  39.59 
 
 		 470 aa  190  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  37.41 
 
 		 466 aa  188  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  38.91 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  39.8 
 
 		 472 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  39.8 
 
 		 472 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  39.8 
 
 		 472 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  41.18 
 
 		 269 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  41.18 
 
 		 269 aa  185  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  39.12 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  41.03 
 
 		 470 aa  184  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  39.46 
 
 		 472 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  39.46 
 
 		 472 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  39.06 
 
 		 473 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  39.19 
 
 		 470 aa  180  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  39.19 
 
 		 470 aa  181  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  34.68 
 
 		 675 aa  180  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  38.44 
 
 		 679 aa  179  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  35.09 
 
 		 680 aa  177  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  37.37 
 
 		 475 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  35.07 
 
 		 672 aa  162  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  35.86 
 
 		 462 aa  162  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  34.78 
 
 		 459 aa  157  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  34.07 
 
 		 462 aa  149  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  34.04 
 
 		 692 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  35.85 
 
 		 416 aa  143  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  34.25 
 
 		 419 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  33.44 
 
 		 507 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  33.44 
 
 		 507 aa  140  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  34.83 
 
 		 511 aa  139  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  32.48 
 
 		 515 aa  138  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  33.45 
 
 		 511 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  33.45 
 
 		 511 aa  137  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  33.55 
 
 		 522 aa  137  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  34.77 
 
 		 510 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  34.77 
 
 		 510 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  34.77 
 
 		 510 aa  136  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  34.77 
 
 		 510 aa  135  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  32.86 
 
 		 515 aa  135  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  33.1 
 
 		 511 aa  135  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  34.41 
 
 		 510 aa  134  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  34.32 
 
 		 557 aa  134  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  33.45 
 
 		 542 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  33.99 
 
 		 559 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  34.35 
 
 		 560 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  30.75 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  34.23 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  34.23 
 
 		 559 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  33.66 
 
 		 560 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  32.85 
 
 		 478 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  33.78 
 
 		 508 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  33.99 
 
 		 559 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  33.78 
 
 		 508 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  33.99 
 
 		 559 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  32.05 
 
 		 516 aa  133  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  34.05 
 
 		 510 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  33 
 
 		 508 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  33.99 
 
 		 507 aa  132  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  33.78 
 
 		 508 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  34.8 
 
 		 505 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  34.01 
 
 		 511 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0858  stage V sporulation protein R, truncation  35 
 
 		 196 aa  131  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0864  stage V sporulation protein R  35 
 
 		 196 aa  131  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000203295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  31.66 
 
 		 521 aa  131  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  33.45 
 
 		 509 aa  131  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  30.67 
 
 		 532 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  30.74 
 
 		 507 aa  130  9.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0862  stage V sporulation protein R  36.5 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000240989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  31.52 
 
 		 515 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  33.79 
 
 		 519 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  33.21 
 
 		 449 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  34.6 
 
 		 517 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  33.21 
 
 		 449 aa  129  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  33.69 
 
 		 510 aa  129  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  32.78 
 
 		 521 aa  129  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>