164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3527 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  60.44 
 
 		 499 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  60.44 
 
 		 499 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  60.44 
 
 		 499 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  100 
 
 		 507 aa  1054    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  60.97 
 
 		 495 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  71.49 
 
 		 500 aa  783    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  59.6 
 
 		 513 aa  629  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  60.69 
 
 		 499 aa  626  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  95.7 
 
 		 898 aa  566  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  79.45 
 
 		 775 aa  499  1e-140  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  46.47 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  40.85 
 
 		 485 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  39.51 
 
 		 470 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  36.44 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  40.04 
 
 		 473 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  38.51 
 
 		 470 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  37.14 
 
 		 471 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  38.48 
 
 		 475 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  37.14 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  36.51 
 
 		 472 aa  322  8e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  36.51 
 
 		 472 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  36.85 
 
 		 472 aa  316  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  36.85 
 
 		 472 aa  316  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  37.19 
 
 		 470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  37.19 
 
 		 470 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  36.65 
 
 		 472 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  36.65 
 
 		 472 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  34.97 
 
 		 419 aa  283  7.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  34.35 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  37.35 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  32.24 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  33.33 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  31.71 
 
 		 462 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  30.98 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  38.44 
 
 		 675 aa  220  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  36.7 
 
 		 680 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  38.72 
 
 		 679 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  36.84 
 
 		 672 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  31.38 
 
 		 449 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  31.17 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  36.5 
 
 		 692 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  29.7 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  30.26 
 
 		 515 aa  183  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  39.78 
 
 		 269 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  39.93 
 
 		 269 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  29.54 
 
 		 541 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  30.58 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  30.58 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  29.3 
 
 		 516 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  28.74 
 
 		 541 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  30 
 
 		 556 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  28.88 
 
 		 532 aa  178  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  30.18 
 
 		 511 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  28.48 
 
 		 515 aa  177  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  30 
 
 		 519 aa  177  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  27.91 
 
 		 515 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  29.16 
 
 		 516 aa  176  9e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  29.52 
 
 		 508 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  29.88 
 
 		 511 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 510 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  29.14 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  30.94 
 
 		 510 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  29.72 
 
 		 508 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  28.96 
 
 		 508 aa  174  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  30.08 
 
 		 505 aa  174  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  29.18 
 
 		 508 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  29.32 
 
 		 508 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4310  hypothetical protein  29.27 
 
 		 549 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  30.74 
 
 		 510 aa  173  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  28.71 
 
 		 509 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  30.32 
 
 		 511 aa  172  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  29.24 
 
 		 542 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  30.54 
 
 		 511 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  29.08 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  28.68 
 
 		 507 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  29.11 
 
 		 517 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  28.98 
 
 		 508 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  29.92 
 
 		 510 aa  171  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  28.98 
 
 		 508 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 522 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  28.98 
 
 		 508 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  30.12 
 
 		 510 aa  169  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  29.1 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  28.92 
 
 		 560 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  27.52 
 
 		 505 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  28.88 
 
 		 521 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>