164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3343 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  100 
 
 		 540 aa  1123    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  79.15 
 
 		 556 aa  899    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  63.96 
 
 		 541 aa  732    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  65.93 
 
 		 543 aa  758    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4310  hypothetical protein  71.22 
 
 		 549 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  63.96 
 
 		 541 aa  733    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  30.36 
 
 		 499 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  30.16 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  29.68 
 
 		 499 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  29.7 
 
 		 507 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  29.52 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  27.24 
 
 		 513 aa  171  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  29.13 
 
 		 499 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  26.94 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  27.93 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  25.29 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  28.08 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  27.98 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  27.98 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  28.7 
 
 		 459 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  27.07 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  26.55 
 
 		 472 aa  150  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  26.68 
 
 		 471 aa  150  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  26.68 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  27.07 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  25.9 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  25.9 
 
 		 472 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  25.9 
 
 		 472 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  25.9 
 
 		 472 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  28.44 
 
 		 416 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  25.9 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  26.35 
 
 		 466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  24.65 
 
 		 419 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  26.52 
 
 		 462 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  24.07 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  25.3 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  30.71 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  24.9 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  35.92 
 
 		 898 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  25.15 
 
 		 516 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  29.79 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  33.17 
 
 		 775 aa  100  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  24.7 
 
 		 509 aa  99.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  29.88 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  24.13 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  24.06 
 
 		 517 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  24.32 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  24.05 
 
 		 515 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  25.33 
 
 		 538 aa  94.4  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  25.25 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  23.67 
 
 		 520 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  23.47 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  23.67 
 
 		 517 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  25.09 
 
 		 517 aa  90.5  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  23.17 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  24.86 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  23.37 
 
 		 521 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  21.97 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  23.68 
 
 		 505 aa  89.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  23.38 
 
 		 504 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  23.25 
 
 		 511 aa  88.6  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  23.26 
 
 		 507 aa  88.6  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  22.51 
 
 		 511 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  22.68 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  23.43 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  22.47 
 
 		 523 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  23.43 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  23.43 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  23.44 
 
 		 516 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  23.43 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  24.5 
 
 		 560 aa  87  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  23 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  23 
 
 		 511 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  23.25 
 
 		 519 aa  87  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  23.9 
 
 		 510 aa  87  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  22.33 
 
 		 521 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  23.2 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  23.04 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  22.91 
 
 		 508 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0974  SpoVR family protein  23.53 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  22.25 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  23.19 
 
 		 511 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  22.89 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  24.25 
 
 		 560 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  23.95 
 
 		 510 aa  86.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6312  SpoVR family protein  25 
 
 		 512 aa  86.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  22.89 
 
 		 508 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>