164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0032 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  79.15 
 
 		 540 aa  899    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  100 
 
 		 556 aa  1157    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  66.05 
 
 		 541 aa  752    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  65.99 
 
 		 543 aa  759    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4310  hypothetical protein  72.19 
 
 		 549 aa  820    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  66.61 
 
 		 541 aa  761    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  30.28 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  30.28 
 
 		 499 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  30.86 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  30 
 
 		 507 aa  180  5.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  30.46 
 
 		 495 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  28.54 
 
 		 513 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  26.69 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  28.14 
 
 		 472 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  27.92 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  27.07 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  29.12 
 
 		 467 aa  157  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  30.37 
 
 		 459 aa  156  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  27.17 
 
 		 470 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  28.14 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  28.14 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  28.27 
 
 		 500 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  28.14 
 
 		 472 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  28.14 
 
 		 472 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  27.77 
 
 		 470 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  27.45 
 
 		 416 aa  150  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  27 
 
 		 470 aa  148  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  27.43 
 
 		 470 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  26.98 
 
 		 462 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  27.45 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  25.54 
 
 		 466 aa  127  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  30.83 
 
 		 473 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  25.6 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  30.83 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  25.05 
 
 		 449 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  30.43 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  29.74 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  32.16 
 
 		 423 aa  105  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  22.79 
 
 		 507 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  23.81 
 
 		 538 aa  103  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  23.83 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  34.95 
 
 		 898 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  23.21 
 
 		 505 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  23.8 
 
 		 517 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  23.23 
 
 		 509 aa  99.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  21.87 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  23.02 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  34.16 
 
 		 775 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  22.68 
 
 		 515 aa  97.8  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  24.95 
 
 		 516 aa  97.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  23.24 
 
 		 521 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  23.45 
 
 		 517 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  23.04 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  23.23 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  23.23 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  22.86 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  23.89 
 
 		 522 aa  94.7  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  22.89 
 
 		 511 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  22.8 
 
 		 520 aa  94.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  24.77 
 
 		 517 aa  94.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  22.29 
 
 		 511 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  22.29 
 
 		 511 aa  94.7  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  22.41 
 
 		 520 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  22.59 
 
 		 516 aa  94.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  23 
 
 		 522 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  22.66 
 
 		 519 aa  94  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  24.95 
 
 		 512 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  23.09 
 
 		 515 aa  93.6  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  23.39 
 
 		 507 aa  93.6  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  24.94 
 
 		 560 aa  93.2  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  22.85 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  22.84 
 
 		 532 aa  93.2  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  24 
 
 		 560 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  23.53 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  25.24 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  25.24 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  25.24 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  22.63 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  25.24 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  22.63 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  22.63 
 
 		 508 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  24.05 
 
 		 519 aa  91.3  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  22.63 
 
 		 508 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  23.01 
 
 		 519 aa  90.9  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  21.76 
 
 		 521 aa  90.5  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  23.17 
 
 		 511 aa  90.1  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  22.67 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  22.67 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0974  SpoVR family protein  25.05 
 
 		 512 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  25.05 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  21.26 
 
 		 508 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  24.44 
 
 		 559 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  21.62 
 
 		 508 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  25.96 
 
 		 510 aa  89  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>