164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1720 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3343  SpoVR-like family protein  65.93 
 
 		 540 aa  758    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0032  SpoVR-like family protein  65.99 
 
 		 556 aa  759    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0255  SpoVR-like family protein  73.11 
 
 		 541 aa  836    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1720  SpoVR-like family protein  100 
 
 		 543 aa  1129    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4310  hypothetical protein  67.96 
 
 		 549 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0239  SpoVR-like family protein  72.74 
 
 		 541 aa  835    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.489745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  30.22 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  28.86 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  29.27 
 
 		 471 aa  178  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  28.05 
 
 		 499 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  28.05 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  28.05 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  28.83 
 
 		 513 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  29.14 
 
 		 507 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  28.63 
 
 		 473 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  26.75 
 
 		 485 aa  173  9e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  29.27 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  28.07 
 
 		 472 aa  170  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  28.07 
 
 		 472 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  27.96 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  27.96 
 
 		 472 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  28.48 
 
 		 472 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  27.47 
 
 		 475 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  30 
 
 		 416 aa  167  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  28.09 
 
 		 470 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  27.87 
 
 		 467 aa  166  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  28.66 
 
 		 499 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  27.47 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  29.1 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  27.73 
 
 		 470 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  27.73 
 
 		 470 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  26.69 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  26.72 
 
 		 500 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  26.68 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  24.76 
 
 		 462 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  27.49 
 
 		 478 aa  127  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  27.08 
 
 		 462 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  25.25 
 
 		 449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  25.25 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  31.35 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  24.95 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  23.77 
 
 		 515 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  25.1 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  24.51 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  24.26 
 
 		 516 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  23.32 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  24.45 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  24.31 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  23.82 
 
 		 508 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  24.45 
 
 		 508 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  23.23 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  23.87 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  24.5 
 
 		 508 aa  97.8  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 775 aa  97.4  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  23.27 
 
 		 517 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1636  SpoVR family protein  22.57 
 
 		 504 aa  97.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000747677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  23.79 
 
 		 508 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  22.14 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  23.2 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  22.14 
 
 		 522 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  22.96 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  22.92 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  23.04 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  22.13 
 
 		 522 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  23.99 
 
 		 520 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  22.92 
 
 		 511 aa  94  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  23.12 
 
 		 523 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  23.15 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  23.62 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  32.04 
 
 		 898 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  23.3 
 
 		 509 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3487  SpoVR family protein  23.5 
 
 		 512 aa  92  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241137  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  24.57 
 
 		 560 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  23.26 
 
 		 520 aa  92  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  24.91 
 
 		 521 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  24.14 
 
 		 511 aa  92  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  21.22 
 
 		 521 aa  91.3  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  23.77 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  22.83 
 
 		 516 aa  91.3  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  26.63 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  24.43 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  26.63 
 
 		 511 aa  90.9  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  90.9  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  26.15 
 
 		 510 aa  90.5  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  25.93 
 
 		 511 aa  90.5  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  23.6 
 
 		 520 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  25.75 
 
 		 560 aa  90.1  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>