164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2004 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  100 
 
 		 470 aa  984    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  61.86 
 
 		 485 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  57.68 
 
 		 473 aa  565  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  56.93 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  57.36 
 
 		 471 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  57.02 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  57.02 
 
 		 472 aa  558  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  57.02 
 
 		 472 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  56.72 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  57.45 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  57.23 
 
 		 470 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  56.5 
 
 		 470 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  56.81 
 
 		 472 aa  553  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  56.81 
 
 		 472 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  56.81 
 
 		 472 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  53.59 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0593  SpoVR family protein  47.95 
 
 		 419 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0625  SpoVR family protein  52.59 
 
 		 416 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  48.93 
 
 		 459 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0453  SpoVR family protein  43.26 
 
 		 423 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  38.55 
 
 		 513 aa  347  4e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  40 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  39.71 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  39.51 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  39.5 
 
 		 499 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  60.9 
 
 		 269 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  39.29 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  40.08 
 
 		 500 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  59.93 
 
 		 269 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  37.37 
 
 		 499 aa  322  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  37.82 
 
 		 462 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  34.51 
 
 		 467 aa  293  7e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  35.08 
 
 		 478 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  36.56 
 
 		 462 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  36.54 
 
 		 449 aa  264  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  36.32 
 
 		 449 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0862  stage V sporulation protein R  53.57 
 
 		 196 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000240989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0858  stage V sporulation protein R, truncation  51.53 
 
 		 196 aa  211  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0864  stage V sporulation protein R  51.53 
 
 		 196 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000203295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  31.37 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  31.37 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  30.4 
 
 		 512 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  29.62 
 
 		 517 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  30.93 
 
 		 507 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  31.52 
 
 		 508 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  32.38 
 
 		 505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  31.98 
 
 		 508 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 508 aa  190  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  30.61 
 
 		 515 aa  190  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  31.32 
 
 		 508 aa  190  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  30.15 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 508 aa  189  7e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  30.3 
 
 		 509 aa  189  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  31.11 
 
 		 508 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  29.68 
 
 		 511 aa  186  5e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  31.04 
 
 		 517 aa  187  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  29.77 
 
 		 504 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1636  SpoVR family protein  30.46 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000747677  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  39.34 
 
 		 775 aa  186  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  29.98 
 
 		 515 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  30.33 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  30.11 
 
 		 519 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  29.58 
 
 		 511 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  30.51 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  29.96 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  28.78 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  41.03 
 
 		 898 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  28.9 
 
 		 517 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  32.73 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  28.9 
 
 		 517 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  28.69 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  31.06 
 
 		 516 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  29.5 
 
 		 506 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  28.72 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  29.42 
 
 		 511 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  30.74 
 
 		 519 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  28.9 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  29.54 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  29.54 
 
 		 507 aa  181  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  28.72 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  29.65 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  30.13 
 
 		 532 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  28.84 
 
 		 521 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  27.86 
 
 		 552 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  29.35 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  29.14 
 
 		 510 aa  176  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  29.35 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  29.35 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  29.35 
 
 		 510 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  28.93 
 
 		 510 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  31.7 
 
 		 513 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  27.86 
 
 		 576 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  28.06 
 
 		 520 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  28.07 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  28.57 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>