164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0029 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0029  SpoVR family protein  100 
 
 		 692 aa  1386    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0800461 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1747  SpoVR family protein  56.69 
 
 		 675 aa  713    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0409  stage V sporulation protein R-like protein  54.74 
 
 		 672 aa  701    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.156049  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2234  stage V sporulation protein R-like protein  54.88 
 
 		 680 aa  727    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.43304  normal  0.276408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3370  SpoVR family protein  56.1 
 
 		 679 aa  709    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.390423  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4653  SpoVR family protein  37.64 
 
 		 499 aa  201  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.283151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2637  SpoVR family protein  40.48 
 
 		 499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0820118  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2731  SpoVR family protein  40 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.792518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1228  hypothetical protein  40 
 
 		 499 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.231331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2539  SpoVR family protein  39.47 
 
 		 495 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.624214 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1819  SpoVR family protein  38.03 
 
 		 467 aa  195  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0947722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2992  SpoVR family protein  37.54 
 
 		 513 aa  194  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308684  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4172  SpoVR family protein  35.19 
 
 		 500 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3527  SpoVR family protein  35.46 
 
 		 507 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.103557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2208  SpoVR family protein  34.63 
 
 		 775 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1381  SpoVR family protein  33.67 
 
 		 898 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2507  stage V sporulation-like protein, SpoVR  31.63 
 
 		 478 aa  147  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0491  SpoVR family protein  27.89 
 
 		 462 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.488778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0857  stage V sporulation protein R  29.18 
 
 		 470 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000642993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0853  stage V sporulation protein R  29.18 
 
 		 470 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0822  stage V sporulation protein R  28.9 
 
 		 472 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3004  SpoVR family protein  29.62 
 
 		 459 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1395  SpoVR family protein  30.29 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0646  SpoVR family protein  29.18 
 
 		 470 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4512  stage V sporulation protein R  28.61 
 
 		 471 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1203  hypothetical protein  29.48 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1332  stage V sporulation protein R  27.65 
 
 		 449 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0448775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1539  stage V sporulation protein R  27.94 
 
 		 449 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0967984  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0551  SpoVR family protein  29.33 
 
 		 475 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0680  SpoVR family protein  28.05 
 
 		 471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0680  stage V sporulation protein R  28.7 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0668  stage V sporulation protein R  28.7 
 
 		 472 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0929  stage V sporulation protein R  28.7 
 
 		 472 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2004  SpoVR family protein  29.3 
 
 		 470 aa  129  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0731  stage V sporulation protein R  28.41 
 
 		 472 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0767  stage V sporulation protein R  28.41 
 
 		 472 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1158  SpoVR family protein  29.04 
 
 		 485 aa  126  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  26.47 
 
 		 516 aa  120  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0832  stage V sporulation protein R  29.11 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000211556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0838  stage V sporulation protein R  29.35 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08767e-57 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  29.91 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  29.91 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  29.31 
 
 		 521 aa  119  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  28.74 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  28.74 
 
 		 517 aa  118  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  29.63 
 
 		 522 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  28.65 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  28.2 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  27.95 
 
 		 520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  27.65 
 
 		 519 aa  115  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  29.39 
 
 		 522 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  27.35 
 
 		 519 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  28.61 
 
 		 560 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  26.56 
 
 		 510 aa  114  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 560 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  28.98 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 516 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  27.78 
 
 		 542 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  27.35 
 
 		 532 aa  111  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  29.02 
 
 		 517 aa  111  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  26.43 
 
 		 510 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 576 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  28.32 
 
 		 552 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  28.93 
 
 		 515 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  26.2 
 
 		 511 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  27.78 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  27.22 
 
 		 559 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  27.14 
 
 		 557 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  25.7 
 
 		 508 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0512  hypothetical protein  28.53 
 
 		 466 aa  108  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  27.38 
 
 		 507 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  27.09 
 
 		 507 aa  108  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  27.09 
 
 		 507 aa  108  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  26.61 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  27.38 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  27.38 
 
 		 559 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  27.51 
 
 		 559 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  27.51 
 
 		 559 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  27.78 
 
 		 519 aa  107  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  26.44 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  26.86 
 
 		 507 aa  106  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  25.5 
 
 		 507 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>