More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4372 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3069  transcriptional regulator, XRE family  55.04 
 
 		 1191 aa  1288    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.251884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4372  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 1188 aa  2456    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00730956  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  61.83 
 
 		 640 aa  628  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  59.72 
 
 		 636 aa  617  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  59.33 
 
 		 645 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  58.66 
 
 		 653 aa  596  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  57.06 
 
 		 794 aa  581  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  55.98 
 
 		 632 aa  573  1e-161  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  56.8 
 
 		 796 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  55.84 
 
 		 649 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  55.82 
 
 		 633 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  56.66 
 
 		 644 aa  561  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  55.4 
 
 		 795 aa  562  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  56.46 
 
 		 802 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  56.92 
 
 		 633 aa  557  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  56.16 
 
 		 802 aa  558  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  56.14 
 
 		 796 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  52.48 
 
 		 628 aa  559  1e-157  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  56.19 
 
 		 642 aa  553  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  52.07 
 
 		 640 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  52.06 
 
 		 650 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  54.56 
 
 		 634 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.35 
 
 		 642 aa  546  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  54.98 
 
 		 795 aa  544  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  54.04 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.64 
 
 		 642 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.47 
 
 		 638 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  54.3 
 
 		 641 aa  539  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  54.74 
 
 		 800 aa  535  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  54.94 
 
 		 810 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  53.06 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  54.74 
 
 		 801 aa  535  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  53.32 
 
 		 813 aa  533  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  52.21 
 
 		 651 aa  534  1e-150  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  51.19 
 
 		 637 aa  534  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  55.01 
 
 		 805 aa  535  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.98 
 
 		 633 aa  535  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  52.16 
 
 		 644 aa  534  1e-150  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0006  DNA gyrase subunit B  54.49 
 
 		 661 aa  532  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.925878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  54.39 
 
 		 804 aa  531  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  54.58 
 
 		 645 aa  531  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  52.55 
 
 		 636 aa  532  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  55.01 
 
 		 806 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  54.64 
 
 		 635 aa  531  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  55.93 
 
 		 640 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  52.52 
 
 		 814 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 806 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  52.04 
 
 		 654 aa  527  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 806 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  54.14 
 
 		 795 aa  528  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0005  DNA gyrase, B subunit  52.96 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.217672  normal  0.192252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0004  DNA gyrase, B subunit  54.97 
 
 		 817 aa  527  1e-148  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  54.81 
 
 		 806 aa  529  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0005  DNA gyrase, B subunit  56.15 
 
 		 808 aa  523  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  54.96 
 
 		 807 aa  523  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3095  DNA gyrase, B subunit  53.77 
 
 		 803 aa  524  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  50.59 
 
 		 644 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  55.07 
 
 		 649 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00040  DNA gyrase subunit B  54.71 
 
 		 806 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0005  DNA gyrase, B subunit  52.93 
 
 		 808 aa  526  1e-147  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000624797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  52.73 
 
 		 810 aa  523  1e-147  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0004  DNA gyrase, B subunit  53.02 
 
 		 807 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 812 aa  526  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  55.49 
 
 		 635 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1905  DNA gyrase, B subunit  51.65 
 
 		 821 aa  522  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.222448 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  52.22 
 
 		 769 aa  521  1e-146  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  51.57 
 
 		 659 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  50.53 
 
 		 640 aa  522  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  52.36 
 
 		 805 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.88 
 
 		 643 aa  521  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 		 636 aa  520  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  51.38 
 
 		 636 aa  520  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  53.32 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  52.08 
 
 		 637 aa  520  1e-146  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  53.88 
 
 		 633 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  52.02 
 
 		 769 aa  520  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  54.31 
 
 		 806 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 		 805 aa  522  1e-146  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  51.37 
 
 		 649 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  50.58 
 
 		 627 aa  521  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  53.25 
 
 		 638 aa  521  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  53.45 
 
 		 638 aa  522  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  51.76 
 
 		 654 aa  522  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  52.22 
 
 		 769 aa  522  1e-146  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  52.37 
 
 		 804 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  50.96 
 
 		 655 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  54.15 
 
 		 640 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  52.17 
 
 		 805 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  52.95 
 
 		 805 aa  519  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  52.37 
 
 		 804 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  52.56 
 
 		 805 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  51.08 
 
 		 825 aa  517  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.95 
 
 		 640 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  54.24 
 
 		 640 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  51.59 
 
 		 772 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>