113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3022 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 1597 aa  3264    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  28.6 
 
 		 2759 aa  168  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.77 
 
 		 464 aa  125  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2975  hypothetical protein  28.61 
 
 		 645 aa  125  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  28 
 
 		 451 aa  111  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.61 
 
 		 531 aa  108  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.7 
 
 		 491 aa  105  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 		 551 aa  104  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25.35 
 
 		 470 aa  102  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.24 
 
 		 444 aa  99.4  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  25.79 
 
 		 449 aa  98.2  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  28.45 
 
 		 324 aa  94.7  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.04 
 
 		 444 aa  94  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  26.73 
 
 		 443 aa  94  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  24.41 
 
 		 385 aa  94.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  26.79 
 
 		 951 aa  92.8  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  24.33 
 
 		 488 aa  90.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  24.54 
 
 		 967 aa  90.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  23.79 
 
 		 715 aa  83.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  24.53 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3148  HNH nuclease  35.37 
 
 		 263 aa  80.5  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  24 
 
 		 531 aa  80.5  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 468 aa  77  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.9 
 
 		 440 aa  77  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3129  metallophosphoesterase  38.14 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  26.14 
 
 		 453 aa  75.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.54 
 
 		 517 aa  73.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 509 aa  72  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  21.35 
 
 		 843 aa  72  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.16 
 
 		 509 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  22.2 
 
 		 698 aa  70.9  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  23.35 
 
 		 590 aa  70.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  21.09 
 
 		 706 aa  68.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  22.91 
 
 		 707 aa  68.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  23.03 
 
 		 744 aa  67.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  21.86 
 
 		 494 aa  67.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  35 
 
 		 654 aa  65.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  21.55 
 
 		 558 aa  64.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 		 466 aa  64.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 479 aa  64.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.64 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0026  hypothetical protein  24.9 
 
 		 346 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.410419  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.43 
 
 		 652 aa  62.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  23.71 
 
 		 706 aa  62  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  46.55 
 
 		 466 aa  61.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  21.41 
 
 		 489 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  26.24 
 
 		 630 aa  55.1  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  21.15 
 
 		 489 aa  55.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2488  hypothetical protein  27.14 
 
 		 925 aa  54.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  24.07 
 
 		 456 aa  53.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  22.67 
 
 		 786 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  23.22 
 
 		 595 aa  54.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  25.11 
 
 		 451 aa  52.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  28.05 
 
 		 559 aa  51.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 809 aa  51.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  27.03 
 
 		 809 aa  51.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 536 aa  52  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  28.72 
 
 		 799 aa  50.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1278  Hef nuclease  21.29 
 
 		 751 aa  51.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000986407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  28.38 
 
 		 784 aa  50.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  34.09 
 
 		 493 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  50 
 
 		 462 aa  50.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  27.34 
 
 		 886 aa  50.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.66 
 
 		 633 aa  50.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04056  DNA helicase of superfamily II  27.97 
 
 		 796 aa  50.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 455 aa  50.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0183  Hef nuclease  21.43 
 
 		 749 aa  49.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818144  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2892  hypothetical protein  27.52 
 
 		 659 aa  49.3  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271142  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  27.11 
 
 		 796 aa  49.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  34.69 
 
 		 554 aa  49.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  21.53 
 
 		 563 aa  48.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 469 aa  48.9  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  21.66 
 
 		 582 aa  48.9  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1062  type III restriction enzyme, res subunit  25.23 
 
 		 1138 aa  48.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  29.01 
 
 		 650 aa  48.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0640  Hef nuclease  20.84 
 
 		 749 aa  48.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761737  hitchhiker  0.00497307 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  28.29 
 
 		 630 aa  48.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  34.69 
 
 		 545 aa  47.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  22.61 
 
 		 584 aa  47.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3199  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.89 
 
 		 696 aa  47.8  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.120819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  31.9 
 
 		 575 aa  47.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 794 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 		 788 aa  48.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  27.78 
 
 		 971 aa  47.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 593 aa  47.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10063  DNA helicase (Eurofung)  25.19 
 
 		 971 aa  47  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.301259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.86 
 
 		 451 aa  47  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  27.83 
 
 		 893 aa  47  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  24.26 
 
 		 458 aa  46.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  22.62 
 
 		 566 aa  46.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  31.29 
 
 		 549 aa  46.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 572 aa  46.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  31.63 
 
 		 548 aa  46.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 485 aa  46.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  27.64 
 
 		 485 aa  46.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  30.2 
 
 		 795 aa  46.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 628 aa  45.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  32.76 
 
 		 577 aa  45.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>