214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1946 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  100 
 
 		 108 aa  218  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  51.89 
 
 		 107 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  55.06 
 
 		 106 aa  116  7.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  48.68 
 
 		 103 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  47.89 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  39.81 
 
 		 212 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  40 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  31.93 
 
 		 123 aa  66.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  34.48 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  40.58 
 
 		 98 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 213 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  45.71 
 
 		 98 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  37.68 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  35.14 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  42.03 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  32 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  32.88 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  31.37 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  39.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  40.3 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  39.73 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  40 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  43.84 
 
 		 110 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  36.25 
 
 		 118 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  33.72 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  33.72 
 
 		 230 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.79 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  35.79 
 
 		 217 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  47.14 
 
 		 292 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  33.67 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  35 
 
 		 118 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  40 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 221 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 266 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0197  putative cytochrome C signal peptide protein  42.42 
 
 		 206 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3538  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.250632  normal  0.0110108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  31.87 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  34.25 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  30 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1422  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  32.88 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  29.35 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  29.17 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  39.22 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 287 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  29.27 
 
 		 418 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  29.63 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0429  cytochrome c class I  38.46 
 
 		 239 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.149382  normal  0.809488 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 218 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  32 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.08 
 
 		 206 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  32.65 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  30 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3308  cytochrome c class I  36.92 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  30.43 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  36.71 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0082  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 238 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000520703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32530  putative cytochrome c  36.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.274349 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  38.57 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  28.72 
 
 		 318 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2475  putative cytochrome C oxidase (subunit III) transmembrane protein  36.11 
 
 		 307 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.48971  normal  0.0879223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  40.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  31.52 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0651  putative periplasmic cytochrome c  36.92 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471094  normal  0.667908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  35.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  32.31 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4157  cytochrome c, class I  32.22 
 
 		 236 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  31.68 
 
 		 196 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1799  cytochrome c family protein  32.26 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000599943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  33.73 
 
 		 211 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1569  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0100945  normal  0.526038 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 200 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  40.3 
 
 		 216 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2776  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.26 
 
 		 310 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000169467 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  34.31 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  30.56 
 
 		 219 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2279  cytochrome c  31.37 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  33.77 
 
 		 227 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 273 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3377  cytochrome c class I  34.12 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0523  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1185  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  35.44 
 
 		 212 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  34.12 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  39.71 
 
 		 108 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3191  cytochrome c, class I  29.31 
 
 		 219 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2392  cytochrome c, class I  40.26 
 
 		 214 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  33.72 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 217 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2756  putative cytochrome c  35.21 
 
 		 217 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.170388  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>