281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3936 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  874    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0165  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000668995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2506  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 431 aa  189  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0421  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 433 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0125  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 421 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000276645  decreased coverage  0.0000206769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2748  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 441 aa  143  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 440 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2661  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1724  hypothetical protein  25.26 
 
 		 402 aa  87.8  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.27513  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0024  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 406 aa  86.3  9e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1979  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.44928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  26.51 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.16 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0041  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.61 
 
 		 530 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.216862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 445 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1041  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0922  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.46 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 444 aa  57  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2623  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 445 aa  57  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.79 
 
 		 491 aa  56.6  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.17 
 
 		 509 aa  55.8  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0528  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 484 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000187583  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 480 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  23.43 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23.31 
 
 		 490 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.14 
 
 		 424 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 457 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 504 aa  53.9  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.81 
 
 		 528 aa  53.5  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002915  permease  23.14 
 
 		 438 aa  53.5  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.08 
 
 		 505 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 460 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 406 aa  53.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3415  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 390 aa  52.4  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.800917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2019  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 386 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.135627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2184  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.56 
 
 		 514 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.208618  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  19.92 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  24.31 
 
 		 487 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2425  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 481 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.818944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 682 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 682 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_002936  DET0805  major facilitator family transporter  24.63 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.03228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.77 
 
 		 682 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  23.37 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 424 aa  50.1  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 453 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0494  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.236521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.55 
 
 		 539 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  20.69 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.66 
 
 		 505 aa  49.7  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 483 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.56 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  25.53 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1768  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0114747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.15 
 
 		 521 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  20.63 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.71 
 
 		 532 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.17 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  19.69 
 
 		 404 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 392 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  27.81 
 
 		 513 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1147  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 702 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.624322  normal  0.188028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  29.46 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 519 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1619  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 430 aa  47.8  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00015243  normal  0.333311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>