144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1021 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  100 
 
 
360 aa  701    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1524  major facilitator transporter  63.1 
 
 
354 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  58.61 
 
 
369 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1458  major facilitator transporter  60.78 
 
 
359 aa  349  3e-95  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  24.07 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  23.78 
 
 
381 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  24.07 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.5 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  24.52 
 
 
396 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  24.79 
 
 
381 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  23.5 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  23.5 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  24.51 
 
 
381 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  24.51 
 
 
399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.36 
 
 
384 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.04 
 
 
387 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
400 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.33 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.34 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  24.13 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.92 
 
 
409 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
391 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
404 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  24.13 
 
 
505 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
396 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
519 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.03 
 
 
506 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
519 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
519 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 
519 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25 
 
 
400 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.06 
 
 
400 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  25.67 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  25.67 
 
 
397 aa  53.5  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  23.94 
 
 
370 aa  52.8  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.33 
 
 
506 aa  52.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.25 
 
 
517 aa  52.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.61 
 
 
519 aa  52.8  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  23.42 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  23.77 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.48 
 
 
399 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  22.96 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  22.63 
 
 
399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  23.45 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  22.87 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.16 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1203  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
399 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
521 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.64 
 
 
520 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0745161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  28.57 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  22.87 
 
 
399 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.14 
 
 
400 aa  50.1  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2346  major facilitator superfamily transporter  31.97 
 
 
410 aa  49.7  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1511  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
395 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  22.37 
 
 
399 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  27.46 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
397 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1516  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 
527 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.89 
 
 
520 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 
520 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.21 
 
 
388 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27.21 
 
 
388 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
406 aa  46.6  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  23.28 
 
 
391 aa  46.6  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
519 aa  46.6  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1446  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.19 
 
 
524 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0633713  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 
509 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640209  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.17 
 
 
521 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 
519 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68140  drug efflux transporter  27.89 
 
 
509 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000279343  decreased coverage  0.00567017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5898  drug efflux transporter  27.89 
 
 
509 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 
407 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2593  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.288035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 
512 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01057  hypothetical protein  29.79 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.276646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  29.12 
 
 
411 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
529 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 
528 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 
508 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2547  drug efflux system protein MdtG  29.79 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0112458  normal  0.379099 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2077  drug efflux system protein MdtG  29.79 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2079  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.25 
 
 
511 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352651  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.96 
 
 
480 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  31.41 
 
 
528 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>