109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1651 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  100 
 
 		 369 aa  702    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  58.61 
 
 		 360 aa  385  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1524  major facilitator transporter  59.27 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1458  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 359 aa  305  6e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  28.4 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.39 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  28.79 
 
 		 388 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  23.24 
 
 		 400 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  23.51 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 400 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  23.1 
 
 		 506 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  23.85 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  22.55 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  26.92 
 
 		 402 aa  53.5  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_003296  RS00896  transport transmembrane protein  29.41 
 
 		 406 aa  52.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.124825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  30.36 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.29 
 
 		 409 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  24.32 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.63 
 
 		 517 aa  49.7  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.59 
 
 		 396 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.4 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.4 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  24.27 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.23 
 
 		 480 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.76 
 
 		 520 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 519 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.87 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 519 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  23.9 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  23.37 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  36.36 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 419 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 521 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  24.73 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  24.73 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 519 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  30.95 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2459  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.95 
 
 		 381 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 415 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 423 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0322  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.516199 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.5 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.01 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 509 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.68 
 
 		 381 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 		 493 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1385  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.52 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.2 
 
 		 512 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.13 
 
 		 519 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0184869 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 381 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1261  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.14 
 
 		 519 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.41 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1997  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 467 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.956973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.7 
 
 		 534 aa  43.5  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5446  putative MFS superfamily transport protein  34.62 
 
 		 484 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.85 
 
 		 520 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.85 
 
 		 520 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.7 
 
 		 512 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>