28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1458 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1458  major facilitator transporter  100 
 
 
359 aa  674    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  61.88 
 
 
360 aa  410  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1524  major facilitator transporter  61.24 
 
 
354 aa  390  1e-107  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  54.62 
 
 
369 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  26.33 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
397 aa  49.7  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  22.93 
 
 
391 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  35.06 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.92 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  26.92 
 
 
388 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2339  major facilitator transporter  27.25 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0304665  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4275  major facilitator transporter  30.07 
 
 
470 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
477 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
495 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  34.81 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  26.62 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  26.62 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5188  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
531 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.401101  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5031  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
523 aa  43.1  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.654254  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  24.49 
 
 
387 aa  43.1  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
531 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.584258  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.8 
 
 
524 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3274  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 
531 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.028442  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 
530 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.228194  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 
407 aa  42.7  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.21 
 
 
528 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  30.28 
 
 
495 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>