86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1524 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1524  major facilitator transporter  100 
 
 		 354 aa  682    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1021  major facilitator transporter  63.1 
 
 		 360 aa  421  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.394996  hitchhiker  1.70461e-18 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1651  major facilitator transporter  59.27 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.95482 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1458  major facilitator transporter  61.08 
 
 		 359 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.51 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.31 
 
 		 405 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  25.4 
 
 		 400 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  25.54 
 
 		 400 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.73 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 400 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0775  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 385 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0509  major facilitator superfamily permease  30.71 
 
 		 403 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0813  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.46 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  33.57 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  26.09 
 
 		 506 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  31.33 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  25.07 
 
 		 506 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1042  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0707168 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1743  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.14993  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1058  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.080151  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.142041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 407 aa  47.4  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2561  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0307568  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1918  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190934  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.43 
 
 		 519 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.27 
 
 		 505 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2083  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.39 
 
 		 529 aa  46.6  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.438087  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 413 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.56 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.08 
 
 		 521 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0726  putative multidrug resistance protein  32.16 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3239  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.71 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  32.47 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  26.11 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 432 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 493 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177807  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.29 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4644  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121761  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  25.73 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  23.7 
 
 		 399 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  21.89 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 519 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  27.27 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.75 
 
 		 517 aa  43.9  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.48 
 
 		 507 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  22.91 
 
 		 432 aa  43.9  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 507 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 511 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1635  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 		 520 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296627  decreased coverage  0.000294236 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  21.41 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2689  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 511 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0761069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0850  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 406 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 445 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1624  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 532 aa  43.5  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  27.86 
 
 		 409 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3215  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0334409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 		 509 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.41 
 
 		 520 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 412 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2250  alpha-ketoglutarate permease  25.56 
 
 		 426 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000207173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>