More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1041 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0922  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  100 
 
 
487 aa  949    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1041  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
487 aa  949    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000138776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.3 
 
 
504 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
509 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.63 
 
 
509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.63 
 
 
509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  51.41 
 
 
504 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  50.1 
 
 
509 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.82 
 
 
504 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.48 
 
 
504 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.82 
 
 
504 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.05 
 
 
504 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.82 
 
 
504 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.82 
 
 
504 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.58 
 
 
504 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.58 
 
 
519 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.58 
 
 
504 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1779  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  48.87 
 
 
520 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38448  unclonable  0.00000000116602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4890  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  51.93 
 
 
513 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0326454  normal  0.212856 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0043  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.48 
 
 
504 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.258133  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.62 
 
 
504 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3285  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.48 
 
 
501 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3357  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.77 
 
 
505 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299723 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.87 
 
 
672 aa  348  1e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.8 
 
 
666 aa  347  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  43.54 
 
 
535 aa  345  1e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.64 
 
 
528 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.01 
 
 
569 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.26 
 
 
682 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.26 
 
 
682 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.26 
 
 
682 aa  334  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.66 
 
 
680 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2318  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.69 
 
 
678 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.48 
 
 
558 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.770491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.13 
 
 
650 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.82 
 
 
685 aa  325  1e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.14 
 
 
539 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8653  Arabinose efflux permease-like protein  45.32 
 
 
666 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.96 
 
 
685 aa  319  6e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.74 
 
 
676 aa  317  3e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.33 
 
 
522 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.12 
 
 
697 aa  312  9e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2169  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.15 
 
 
554 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.82 
 
 
525 aa  311  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.31 
 
 
538 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00903391  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0662  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.85 
 
 
525 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3945  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.23 
 
 
528 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00181565  hitchhiker  0.00620132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.34 
 
 
535 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40 
 
 
641 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4795  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 
534 aa  299  6e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29039  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 
567 aa  299  8e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5285  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
491 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1424  major facilitator family transporter  40.78 
 
 
537 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000410629  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.28 
 
 
685 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00129972  normal  0.114111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.68 
 
 
526 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.53 
 
 
516 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14720  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.3 
 
 
524 aa  289  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.369508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42 
 
 
593 aa  289  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.58 
 
 
565 aa  289  1e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  41.81 
 
 
1062 aa  288  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.18 
 
 
538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.98 
 
 
530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4024  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.22 
 
 
562 aa  282  8.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.736768  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2535  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.49 
 
 
575 aa  282  9e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4090  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.86 
 
 
523 aa  282  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.588022  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.26 
 
 
539 aa  280  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.81 
 
 
514 aa  279  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0210  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 
592 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.852197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.76 
 
 
532 aa  278  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
512 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.18 
 
 
523 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.14 
 
 
621 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2560  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.16 
 
 
557 aa  274  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.577395  normal  0.137403 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.54 
 
 
541 aa  273  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11905  integral membrane protein  42.82 
 
 
687 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 
512 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0306  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.95 
 
 
555 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509937  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.59 
 
 
538 aa  271  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  34.56 
 
 
537 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3998  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.65 
 
 
550 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  34.56 
 
 
537 aa  270  4e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  34.56 
 
 
537 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.43 
 
 
561 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  34.56 
 
 
476 aa  269  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  34.56 
 
 
537 aa  269  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  34.56 
 
 
537 aa  269  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2674  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.02 
 
 
684 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  34.56 
 
 
537 aa  269  7e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.56 
 
 
537 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.19 
 
 
918 aa  268  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00297311  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4620  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 
566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0331  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  38.26 
 
 
571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0577  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 
537 aa  267  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_1939  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
537 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.926976  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5486  major facilitator superfamily MFS_1  38.94 
 
 
584 aa  266  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0573143  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_1011  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.37 
 
 
522 aa  265  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_19560  arabinose efflux permease family protein  38.82 
 
 
552 aa  263  4e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.301888  normal  0.424094 
 
 
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NC_011886  Achl_3777  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.9 
 
 
554 aa  262  8.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.2 
 
 
592 aa  262  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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