123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1167 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
418 aa  858    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  46.01 
 
 
426 aa  350  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  45.6 
 
 
427 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  51.03 
 
 
415 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.62 
 
 
433 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  32.54 
 
 
374 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  33.77 
 
 
426 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  33.44 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  33.23 
 
 
307 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  29.08 
 
 
793 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 
349 aa  140  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  29.74 
 
 
358 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  30.77 
 
 
451 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.61 
 
 
1115 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  29.74 
 
 
316 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.98 
 
 
1115 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  28.44 
 
 
647 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.4 
 
 
1115 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.4 
 
 
1115 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 
312 aa  124  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  31.46 
 
 
688 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  27.22 
 
 
503 aa  123  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.67 
 
 
1119 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 
430 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  27.68 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  27.68 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  27.68 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  27.68 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  29.01 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  27.68 
 
 
430 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  27.68 
 
 
430 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  30.39 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  30.07 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2002  hypothetical protein  27.59 
 
 
356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00113016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  27.34 
 
 
430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1926  glycoside hydrolase family protein  26.15 
 
 
356 aa  117  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00103696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  26.64 
 
 
430 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  27.24 
 
 
343 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  28.16 
 
 
542 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  29.59 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  25.41 
 
 
470 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0258  glycoside hydrolase family 18  26.74 
 
 
390 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  27.45 
 
 
567 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1111  glycoside hydrolase family 18  28.03 
 
 
426 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.89 
 
 
927 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 
423 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0489  glycoside hydrolase family 18  26.37 
 
 
579 aa  99.8  8e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  25.57 
 
 
444 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  25.69 
 
 
484 aa  94  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2862  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 
329 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.766607  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.92 
 
 
1124 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6504  glycoside hydrolase family 18  27.46 
 
 
580 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462594  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.83 
 
 
1118 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.63 
 
 
1154 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3633  glycosyl hydrolase, family 18  29.26 
 
 
342 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00032654  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.51 
 
 
1101 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 
583 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.65 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2210  hypothetical protein  23.24 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.179103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  24.23 
 
 
521 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  28.85 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1613  glycosyl hydrolase-like protein  30.71 
 
 
807 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.5027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1268  glycosyl hydrolase-like protein  30 
 
 
808 aa  63.9  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2820  hypothetical protein  29.17 
 
 
822 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.59851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  35.66 
 
 
536 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 
541 aa  63.2  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
578 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.31 
 
 
542 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  20.17 
 
 
1002 aa  57.4  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  28.89 
 
 
318 aa  57.4  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  26.21 
 
 
540 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
484 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 
536 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  23.85 
 
 
1132 aa  54.7  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
1782 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  24.17 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  22.52 
 
 
1120 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 
340 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  24.46 
 
 
540 aa  51.2  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  26.99 
 
 
827 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  25.71 
 
 
586 aa  50.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  24.89 
 
 
539 aa  50.4  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  26.72 
 
 
703 aa  50.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  24.4 
 
 
426 aa  50.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  25 
 
 
674 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  24.81 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  26.29 
 
 
674 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  24.48 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  24.48 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  24.48 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  24.48 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  25.18 
 
 
426 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  24.48 
 
 
674 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  24.51 
 
 
868 aa  47.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  25.54 
 
 
651 aa  47.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  25 
 
 
674 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  36.36 
 
 
1115 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  23.43 
 
 
972 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>