More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0904 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0904  farnesyl-diphosphate synthase  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0934  geranyltranstransferase  52.96 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.298715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004257  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  52.76 
 
 		 294 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1383  polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 293 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.444608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1344  polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 293 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00140947  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3002  Polyprenyl synthetase  51.89 
 
 		 293 aa  299  5e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  decreased coverage  0.0000000854993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0413  geranyltranstransferase  55.48 
 
 		 294 aa  296  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.058519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1276  polyprenyl synthetase  51.54 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0835849  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1358  polyprenyl synthetase  51.55 
 
 		 293 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00331153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2789  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00992702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1526  geranyltranstransferase  50.87 
 
 		 293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  50.34 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3477  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 293 aa  287  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.171034  hitchhiker  0.00323812 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2770  polyprenyl synthetase  52.08 
 
 		 293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.409346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2990  polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0298794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01174  geranyltranstransferase  57.09 
 
 		 294 aa  281  9e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1031  geranyltranstransferase  52.98 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3328  polyprenyl synthetase  49.49 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.271135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0888  geranyltranstransferase  53.72 
 
 		 299 aa  275  5e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2435  geranyltranstransferase  50.17 
 
 		 293 aa  275  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.408518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  52.26 
 
 		 292 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0464  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0470  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0462  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0525  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0483  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 299 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3280  geranyltranstransferase  52.65 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3111  geranyltranstransferase  52.35 
 
 		 306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2803  farnesyl-diphosphate synthase  51.55 
 
 		 293 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141503  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2893  geranyltranstransferase  51.66 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3252  geranyltranstransferase  52.01 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3073  geranyltranstransferase  52.35 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1320  polyprenyl synthetase  51.76 
 
 		 296 aa  267  1e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2900  farnesyl-diphosphate synthase  51.55 
 
 		 293 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0370775  hitchhiker  0.000852283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1079  geranyltranstransferase  54.39 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000871553 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  46.74 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  48.41 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00369  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3188  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.574686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0492  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0457  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.914114 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0342  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00373  hypothetical protein  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0452  geranyltranstransferase  50 
 
 		 299 aa  263  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2730  farnesyl-diphosphate synthase  50.86 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00244683  normal  0.486115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2570  polyprenyl synthetase  51.54 
 
 		 293 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0334175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2239  geranyltranstransferase  50.33 
 
 		 296 aa  261  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0504  geranyltranstransferase  49.66 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  47.2 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3084  geranyltranstransferase  50 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1089  geranyltranstransferase  50.69 
 
 		 300 aa  252  5.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  49.83 
 
 		 295 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  47.08 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1599  polyprenyl synthetase  48.06 
 
 		 291 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  48.06 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  46.49 
 
 		 300 aa  242  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  47.65 
 
 		 294 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  47.06 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  50.35 
 
 		 295 aa  237  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  46.74 
 
 		 297 aa  237  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  44.56 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1570  Polyprenyl synthetase  51.12 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2828  farnesyl-diphosphate synthase  47.81 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6782  Polyprenyl synthetase  47.8 
 
 		 293 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.750259  hitchhiker  0.0000580202 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1746  farnesyl-diphosphate synthase  47.24 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  41.64 
 
 		 294 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  44.56 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0274  geranyltranstransferase  44.44 
 
 		 304 aa  231  9e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  44.71 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0363  geranyltranstransferase  46.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  49.83 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0329  geranyltranstransferase  46.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1511  geranyltranstransferase  46.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1705  geranyltranstransferase  46.44 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  48.45 
 
 		 295 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  48.61 
 
 		 295 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0843  geranyltranstransferase  46.1 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2393  geranyltranstransferase  46.1 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2535  geranyltranstransferase  46.1 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0880  farnesyl-diphosphate synthase  45.95 
 
 		 296 aa  228  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  48.97 
 
 		 295 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  44.52 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3775  polyprenyl synthetase  46.46 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0109984  normal  0.0572479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3249  polyprenyl synthetase  46.46 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.923814  normal  0.018819 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  48.6 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  43.84 
 
 		 300 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  41.89 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.71 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.71 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  48.6 
 
 		 295 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  45.76 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4821  polyprenyl synthetase  46.1 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4487  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3649  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3878  polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 294 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.235577 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  43.49 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0613  geranyltranstransferase  45.64 
 
 		 294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>