More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0900 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0900  sensor kinase  100 
 
 		 565 aa  1157    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1066  histidine kinase  40.57 
 
 		 585 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233017 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1956  sensor-kinase  35.58 
 
 		 582 aa  363  6e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1520  sensor-kinase  35.4 
 
 		 582 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1499  sensor-kinase  35.4 
 
 		 582 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000587634 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1785  sensor-kinase  35.58 
 
 		 582 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1483  sensor-kinase  35.58 
 
 		 582 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal  0.317682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003035  tetrathionate reductase sensory transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 607 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3040  histidine kinase  30.69 
 
 		 594 aa  269  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1439  Signal transduction histidine kinase sensor  28.23 
 
 		 713 aa  250  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510885 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 613 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3182  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0468  histidine kinase  28.32 
 
 		 603 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0535  histidine kinase  29.07 
 
 		 602 aa  239  9e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0437  histidine kinase  28.08 
 
 		 607 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3696  histidine kinase  28.77 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0479  histidine kinase  28.15 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3516  histidine kinase  27.9 
 
 		 607 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.295368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0452  histidine kinase  28.25 
 
 		 603 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3861  histidine kinase  27.97 
 
 		 603 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4155  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0665  histidine kinase  30.09 
 
 		 670 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1998  histidine kinase  29.95 
 
 		 617 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3733  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 645 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3859  histidine kinase  30.65 
 
 		 671 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0993209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3676  histidine kinase  29.81 
 
 		 682 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0592  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.98 
 
 		 644 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 626 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0636  ATPase domain-containing protein  30.96 
 
 		 662 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000455288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2089  histidine kinase  28.08 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1417  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2400  sensor histidine kinase  28.14 
 
 		 608 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774596  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0636  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 682 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000492691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1970  histidine kinase  27.59 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.12135 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  27.26 
 
 		 600 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2281  histidine kinase  27.43 
 
 		 558 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.278764 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  26.2 
 
 		 630 aa  183  9.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2451  putative diguanylate cyclase  29.56 
 
 		 651 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.20107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 602 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.85 
 
 		 594 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  32.68 
 
 		 613 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 607 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  28.14 
 
 		 1028 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  31.34 
 
 		 613 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  30.35 
 
 		 612 aa  111  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  29.96 
 
 		 599 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  32.18 
 
 		 601 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.44 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.38 
 
 		 604 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2012  C4-dicarboxylate transport sensor protein  32.28 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 604 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0643  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtB  29.37 
 
 		 789 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.787041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  32.67 
 
 		 604 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07091  histidine kinase  32.23 
 
 		 637 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  32.1 
 
 		 604 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  30.63 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1821  diguanylate cyclase  28.18 
 
 		 821 aa  105  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0645  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.36 
 
 		 1082 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  27.05 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 471 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0356  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.96 
 
 		 667 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.589026  normal  0.448313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001013  signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 624 aa  103  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.47 
 
 		 604 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 602 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  31.42 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.74 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.74 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.74 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 645 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.74 
 
 		 608 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0681  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.01 
 
 		 932 aa  101  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  28.57 
 
 		 604 aa  101  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2451  periplasmic sensor diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.77 
 
 		 802 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312082 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.74 
 
 		 608 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  27.68 
 
 		 588 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 498 aa  100  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1723  histidine kinase  30.54 
 
 		 608 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.10547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  27.82 
 
 		 585 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 487 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  27.39 
 
 		 475 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 604 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3099  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.91 
 
 		 1038 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.754272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  28.75 
 
 		 623 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  30.74 
 
 		 608 aa  100  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 658 aa  100  9e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  29.28 
 
 		 625 aa  100  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  31.09 
 
 		 600 aa  100  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 838 aa  99.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  26.43 
 
 		 846 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  30.43 
 
 		 478 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 398 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 500 aa  99.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2752  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 790 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.296957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>