144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0145 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0145  ATP synthase F1, delta subunit  100 
 
 		 193 aa  397  9.999999999999999e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1126  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.13 
 
 		 278 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1760  ATP synthase F1, delta subunit  32.7 
 
 		 275 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.337923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0897  ATP synthase F1 subunit delta  32 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.856664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3919  ATP synthase F1, delta subunit  31.85 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18230  ATP synthase, F1 delta subunit  32.08 
 
 		 271 aa  77  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.524835  normal  0.215855 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0650  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.94 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299616  normal  0.3492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1215  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.72 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4015  ATP synthase F1, delta subunit  30.26 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3633  ATP synthase F1, delta subunit  28.95 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2123  ATP synthase F1, delta subunit  29.56 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290566  hitchhiker  0.00595269 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1918  ATP synthase F1, delta subunit  24.67 
 
 		 449 aa  69.7  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1777  ATP synthase F1, delta subunit  29.63 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4139  ATP synthase F1, delta subunit  31.37 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.390254  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0333  ATP synthase F1, delta subunit  29.14 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1313  ATP synthase F1 subunit delta  28.05 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10000  ATP synthase, F1 delta subunit  31.34 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.179635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1304  ATP synthase F1, delta subunit  27.16 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1267  ATP synthase F1, delta subunit  27.63 
 
 		 276 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1668  F0F1-type ATP synthase delta subunit-like protein  27.81 
 
 		 270 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1021  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.46 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2451  ATP synthase F1, delta subunit  27.15 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2608  ATP synthase F1, delta subunit  42.42 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31166  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2620  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.95 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4331  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.59 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0727186 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0066  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2200  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.44 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.506317  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1223  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.56 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  24.1 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16421  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.02 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11334  F0F1 ATP synthase subunit delta  25 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  28.78 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19160  ATP synthase, F1 delta subunit  24.67 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3710  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.46 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4741  ATP synthase F1, delta subunit  24.84 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403531  hitchhiker  0.00506687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.17 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15711  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.78 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.572565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6139  ATP synthase F1, delta subunit  29.12 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2410  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.45 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2341  ATP synthase F1, delta subunit  36.36 
 
 		 275 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000891359 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0487  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.88 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.298952  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1545  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.42 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16541  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.43 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.536377  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.32 
 
 		 443 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2605  ATP synthase F1, delta subunit  25.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  28.06 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1252  ATP synthase F1, delta subunit  23.36 
 
 		 448 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.849245  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16311  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.08 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3418  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.68 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3384  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.34 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000127487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2719  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.34 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0173  ATP synthase F1, delta subunit  21.43 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0955649  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2499  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.26 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2140  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.88 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4168  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.38 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0603  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1504  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.22 
 
 		 180 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2095  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.86 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0131  ATP synthase F1, delta subunit  21.51 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04821  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.48 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.33 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.82 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3815  ATP synthase F1, delta subunit  34.72 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0314  ATP synthase F1, delta subunit  22.88 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.240984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2142  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.82146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2180  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.19 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.81 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2189  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.62 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2805  ATP synthase F1, delta subunit  23.57 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.365033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3306  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.85 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00728321  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0620  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.87 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0177  F0F1 ATP synthase subunit delta  20 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1678  ATP synthase F1, delta subunit  25 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4794  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.22 
 
 		 178 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163043  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  24.2 
 
 		 178 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5158  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4991  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5008  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5550  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0201793  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  22.44 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5399  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.03 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.135919999999999e-51 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.01 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2399  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.94 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31663  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  23.57 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0178246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4260  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.17 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2215  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.67 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.169697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4110  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.45 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0395  ATP synthase F1, delta subunit  19.76 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0982  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.12 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1046  ATP synthase F1, delta subunit  29.17 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0144  ATP synthase F1, delta subunit  34.92 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  decreased coverage  0.000353318  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18501  F0F1 ATP synthase subunit delta  20.12 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3363  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.39 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.19453  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2165  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.95 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  23.78 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4498  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.2 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3337  ATP synthase F1 delta subunit  19.21 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.631562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>