102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4091 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  50.62 
 
 		 839 aa  875    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  100 
 
 		 841 aa  1742    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1143  hypothetical protein  37.74 
 
 		 837 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  38.21 
 
 		 833 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2980  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 826 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.376488  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3124  TPR repeat-containing protein  33.45 
 
 		 826 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  33.17 
 
 		 833 aa  415  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  31.83 
 
 		 841 aa  412  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  32.42 
 
 		 826 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  30.6 
 
 		 825 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  29.75 
 
 		 821 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  30.89 
 
 		 823 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 826 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  29.83 
 
 		 822 aa  364  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 822 aa  363  9e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  29.43 
 
 		 820 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  26.77 
 
 		 824 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  27.43 
 
 		 871 aa  307  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  28.46 
 
 		 812 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  26.86 
 
 		 629 aa  88.6  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  24.39 
 
 		 607 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  24.64 
 
 		 616 aa  75.1  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.42 
 
 		 891 aa  73.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.1 
 
 		 605 aa  71.6  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  23.21 
 
 		 635 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  23.1 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  23.16 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1524  motility accessory factor  23.84 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.710571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02911  Maf-1  29.34 
 
 		 700 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  25.29 
 
 		 618 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  23.84 
 
 		 629 aa  65.5  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  22.14 
 
 		 671 aa  63.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1337  PseE  22.55 
 
 		 632 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  23.35 
 
 		 470 aa  63.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  23.34 
 
 		 649 aa  61.6  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  23.48 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1638  motility accessory factor  22.19 
 
 		 661 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0168  motility accessory factor  22.04 
 
 		 638 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000847186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  25.9 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  34.44 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  20.92 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0165  motility accessory factor  23.79 
 
 		 625 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.16921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  21.89 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  20.44 
 
 		 578 aa  57.4  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  26.74 
 
 		 435 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  21.94 
 
 		 647 aa  57.4  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  24.77 
 
 		 666 aa  57  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  26.74 
 
 		 435 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  25.3 
 
 		 589 aa  57  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  23.19 
 
 		 442 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  24.78 
 
 		 430 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  23.19 
 
 		 442 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  26.06 
 
 		 627 aa  56.6  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1335  motility accessory factor  22.11 
 
 		 604 aa  55.5  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0174  hypothetical protein  21.49 
 
 		 662 aa  54.3  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.899538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0451  hypothetical protein  23.53 
 
 		 623 aa  54.3  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  25.08 
 
 		 431 aa  54.3  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01231  hypothetical protein  23.31 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  28.09 
 
 		 507 aa  53.1  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  23.91 
 
 		 626 aa  53.5  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  23.67 
 
 		 440 aa  52.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 465 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 3035 aa  51.6  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 3560 aa  51.2  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 1094 aa  51.6  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.63 
 
 		 417 aa  50.8  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  22.57 
 
 		 617 aa  50.1  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 718 aa  49.3  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 647 aa  49.3  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 4489 aa  49.3  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1523  motility accessory factor  23.02 
 
 		 626 aa  48.1  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 1827 aa  48.1  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2235  hypothetical protein  22.94 
 
 		 648 aa  48.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3565  hypothetical protein  25.99 
 
 		 702 aa  48.1  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1450 aa  48.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  23.08 
 
 		 441 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 435 aa  47  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2413  tetratricopeptide TPR_2  26.63 
 
 		 307 aa  47.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 423 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  22.17 
 
 		 431 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  32.33 
 
 		 623 aa  47.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 878 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 391 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 1085 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6068  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 527 aa  46.6  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 637 aa  46.2  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2550  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 670 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.507483  normal  0.0818134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 754 aa  45.8  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 543 aa  45.4  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 		 810 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1138 aa  45.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  23.88 
 
 		 875 aa  45.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01211  hypothetical protein  21.47 
 
 		 676 aa  45.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1406 aa  45.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 754 aa  44.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 361 aa  44.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1334  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 		 512 aa  44.7  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.278248  normal  0.0416734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  33.8 
 
 		 1213 aa  44.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 4079 aa  44.7  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  44.7  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>