55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1571 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  478  1e-134  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  44.44 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  44.02 
 
 
238 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  45.58 
 
 
238 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  39.08 
 
 
242 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  43.17 
 
 
207 aa  154  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  43.4 
 
 
239 aa  152  4e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  40.31 
 
 
213 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  40 
 
 
216 aa  143  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  39.9 
 
 
204 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  36.79 
 
 
206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  39.56 
 
 
209 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  38.17 
 
 
206 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  34.06 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  42.33 
 
 
220 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  37.87 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  37.74 
 
 
208 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  34.76 
 
 
207 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  31 
 
 
232 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  32.58 
 
 
237 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  30.26 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  32 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  34.46 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  35.29 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  34.51 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  38.54 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  36.19 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  31.85 
 
 
435 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  31.85 
 
 
435 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  41.46 
 
 
440 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  31.54 
 
 
605 aa  52.8  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  26.11 
 
 
431 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0374  motility accessory factor  28.76 
 
 
649 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  30.67 
 
 
446 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  30.67 
 
 
635 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  34.44 
 
 
629 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  30.12 
 
 
629 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  28.77 
 
 
605 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1522  motility accessory factor  28.57 
 
 
653 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  34.12 
 
 
570 aa  46.6  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  37.14 
 
 
577 aa  46.6  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  27.88 
 
 
608 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  47.27 
 
 
442 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  47.27 
 
 
442 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  46.81 
 
 
616 aa  46.2  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  38.89 
 
 
430 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0566  motility accessory factor  26.16 
 
 
666 aa  45.8  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  46.67 
 
 
441 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  29.56 
 
 
833 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1457  hypothetical protein  26.12 
 
 
507 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  38.89 
 
 
430 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  34.38 
 
 
841 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  30.56 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2228  protein of unknown function DUF115  26.36 
 
 
627 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  32.58 
 
 
578 aa  41.6  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>