42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1600 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  89.92 
 
 
238 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  90.76 
 
 
238 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  70.83 
 
 
239 aa  345  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  60.58 
 
 
242 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  45.6 
 
 
213 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  40.27 
 
 
207 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  47.72 
 
 
244 aa  153  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  35.65 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  40.53 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  35.81 
 
 
235 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  43.46 
 
 
204 aa  122  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  38.62 
 
 
206 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  32.89 
 
 
232 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  32.63 
 
 
206 aa  112  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  32.8 
 
 
208 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  36.99 
 
 
162 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  31.28 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  36.09 
 
 
220 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  30.77 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  30.26 
 
 
232 aa  96.7  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  30.16 
 
 
207 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  37.24 
 
 
221 aa  90.9  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  32.89 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  29.34 
 
 
206 aa  64.3  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  33.08 
 
 
205 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  31.11 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  31.13 
 
 
431 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  28.92 
 
 
433 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  26.97 
 
 
365 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.91 
 
 
371 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  29.53 
 
 
396 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  32.58 
 
 
441 aa  43.5  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.35 
 
 
395 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  32.05 
 
 
431 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  34.09 
 
 
435 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  34.09 
 
 
435 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  29.53 
 
 
239 aa  42.4  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  29.17 
 
 
635 aa  42  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  25.68 
 
 
389 aa  41.6  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>