27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3612 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  59.05 
 
 
207 aa  254  7e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  51.92 
 
 
216 aa  214  8e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  47.62 
 
 
206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  46.08 
 
 
209 aa  187  7e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  44.86 
 
 
206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  46.41 
 
 
207 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  44.64 
 
 
238 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  44.2 
 
 
238 aa  166  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  47.37 
 
 
208 aa  165  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  42.86 
 
 
238 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  36.21 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  39.52 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  38.43 
 
 
239 aa  152  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  42.23 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  40.31 
 
 
244 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  39.81 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  38.57 
 
 
232 aa  137  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  38.86 
 
 
232 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  39.91 
 
 
220 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  35.27 
 
 
204 aa  108  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  34.46 
 
 
162 aa  87.8  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  29.06 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  27.27 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  34.95 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  32.59 
 
 
201 aa  62  0.000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  27.93 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>