50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1452 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  483  1e-135  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  72.61 
 
 
238 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  71.55 
 
 
238 aa  347  7e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  70.83 
 
 
238 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  57.68 
 
 
242 aa  281  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  41.85 
 
 
207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  38.81 
 
 
216 aa  155  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  40.31 
 
 
213 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  45.45 
 
 
244 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  41.4 
 
 
209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  34.04 
 
 
232 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  32.73 
 
 
206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  33.48 
 
 
235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  39.05 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  38.15 
 
 
162 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  28.89 
 
 
206 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  35.96 
 
 
220 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  29.31 
 
 
232 aa  101  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  29.96 
 
 
208 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  29.87 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  29.55 
 
 
207 aa  92.4  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  29.28 
 
 
237 aa  91.3  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  31.33 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  32.92 
 
 
201 aa  68.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  33.82 
 
 
205 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  31.01 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  30.87 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.17 
 
 
371 aa  56.6  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  30.06 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  26.71 
 
 
396 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  27.2 
 
 
415 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  27.39 
 
 
441 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  23.9 
 
 
395 aa  45.1  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  28.21 
 
 
430 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.11 
 
 
392 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  30.08 
 
 
392 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  27.97 
 
 
431 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  29.81 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  29.41 
 
 
371 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  27.85 
 
 
578 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  31.4 
 
 
373 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  29.37 
 
 
442 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  32.14 
 
 
365 aa  43.5  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  27.56 
 
 
396 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.75 
 
 
399 aa  42.7  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  27.88 
 
 
413 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  32.43 
 
 
431 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  28.67 
 
 
442 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  29.41 
 
 
373 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  28.57 
 
 
395 aa  42  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>