45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1660 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
395 aa  772    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  79.47 
 
 
407 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  74.03 
 
 
399 aa  574  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  75.51 
 
 
396 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  74.14 
 
 
404 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  74.81 
 
 
407 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  67.65 
 
 
413 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  68.1 
 
 
395 aa  488  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  64.51 
 
 
403 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  66.06 
 
 
399 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.51 
 
 
404 aa  478  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  66.14 
 
 
389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  68.71 
 
 
392 aa  451  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  68.42 
 
 
392 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.1 
 
 
398 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  65.01 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  51.3 
 
 
373 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.93 
 
 
415 aa  363  2e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.42 
 
 
373 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  53.46 
 
 
394 aa  348  9e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.22 
 
 
375 aa  347  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50 
 
 
371 aa  346  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.08 
 
 
373 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  56.23 
 
 
372 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  50.99 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.67 
 
 
390 aa  330  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  46.43 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  71.85 
 
 
239 aa  327  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  46.17 
 
 
394 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  45.92 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  45.92 
 
 
394 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  45.15 
 
 
394 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  47.85 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  51.86 
 
 
390 aa  311  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  46.02 
 
 
399 aa  311  2e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.82 
 
 
371 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  47.04 
 
 
398 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  51.64 
 
 
354 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.8 
 
 
382 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  45.21 
 
 
394 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  60.14 
 
 
156 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  31.82 
 
 
407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  43.48 
 
 
223 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  26.32 
 
 
238 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  28.29 
 
 
238 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>