46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1614 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  100 
 
 
375 aa  740    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  57.41 
 
 
373 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  56.99 
 
 
373 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.22 
 
 
372 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  57.79 
 
 
373 aa  421  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.6 
 
 
371 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.33 
 
 
371 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  52.46 
 
 
365 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.97 
 
 
407 aa  364  1e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.23 
 
 
413 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  56.75 
 
 
396 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.49 
 
 
407 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  49.01 
 
 
403 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.18 
 
 
395 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.97 
 
 
399 aa  347  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.72 
 
 
399 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.56 
 
 
395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  54.77 
 
 
392 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.1 
 
 
404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.04 
 
 
382 aa  335  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.82 
 
 
392 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.7 
 
 
404 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.94 
 
 
415 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.28 
 
 
398 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  52.6 
 
 
389 aa  326  4.0000000000000003e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.38 
 
 
396 aa  321  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.15 
 
 
390 aa  318  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  41.54 
 
 
394 aa  242  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  39.17 
 
 
399 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  55.36 
 
 
239 aa  237  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  39.14 
 
 
390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  37.19 
 
 
394 aa  229  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  37.3 
 
 
394 aa  228  9e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  38.03 
 
 
394 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  37.03 
 
 
394 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  37.03 
 
 
394 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  37.28 
 
 
393 aa  223  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  41.58 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  39.63 
 
 
398 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  35.92 
 
 
394 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  43.7 
 
 
156 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  26.72 
 
 
407 aa  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  42.86 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  37.25 
 
 
203 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3421  thiamine pyrophosphokinase  42.55 
 
 
212 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  23.81 
 
 
242 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>