45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1088 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  100 
 
 		 373 aa  753    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.2 
 
 		 373 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  56.99 
 
 		 375 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  56.34 
 
 		 373 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.25 
 
 		 371 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  57.37 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  54.79 
 
 		 365 aa  410  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.83 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.58 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.7 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.94 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.86 
 
 		 407 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  53.8 
 
 		 396 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.42 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.82 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  49.72 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  55.9 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.66 
 
 		 392 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.91 
 
 		 398 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.23 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.86 
 
 		 404 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.09 
 
 		 407 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.59 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.31 
 
 		 395 aa  342  5e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.33 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  51.68 
 
 		 389 aa  329  4e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.82 
 
 		 390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  44.44 
 
 		 399 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.48 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  40.52 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  39.27 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  40.52 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  40.52 
 
 		 394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  61.78 
 
 		 239 aa  248  9e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  38.92 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  38.35 
 
 		 394 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  37.25 
 
 		 393 aa  240  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  40.3 
 
 		 398 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  39.14 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  33.8 
 
 		 394 aa  186  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  43.33 
 
 		 156 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  39.58 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0426  thiamine pyrophosphokinase  57.14 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  40.91 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  31.4 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>