42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2825 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  100 
 
 		 398 aa  786    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  68.11 
 
 		 394 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  68.11 
 
 		 394 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  68.11 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  68.11 
 
 		 394 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  68.37 
 
 		 394 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  66.41 
 
 		 393 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  65.66 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  52.54 
 
 		 394 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.8 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.89 
 
 		 413 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.13 
 
 		 395 aa  347  2e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.94 
 
 		 399 aa  346  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  46.53 
 
 		 403 aa  345  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.61 
 
 		 396 aa  333  3e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.95 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.31 
 
 		 392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.83 
 
 		 399 aa  326  4.0000000000000003e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.73 
 
 		 392 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  49.58 
 
 		 354 aa  322  8e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.12 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  47.77 
 
 		 396 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.65 
 
 		 407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.04 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.5 
 
 		 398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.41 
 
 		 404 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  45.51 
 
 		 389 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  39.01 
 
 		 373 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  38.57 
 
 		 373 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  39.07 
 
 		 373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  37.5 
 
 		 371 aa  250  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  42.47 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.61 
 
 		 415 aa  245  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  38.01 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  33.52 
 
 		 371 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  38.22 
 
 		 365 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  42.03 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.07 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  46.03 
 
 		 239 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.87 
 
 		 382 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  49.35 
 
 		 156 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  30.54 
 
 		 407 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>