45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1905 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 		 392 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  97.19 
 
 		 392 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  70.45 
 
 		 395 aa  527  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  69.62 
 
 		 396 aa  523  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.55 
 
 		 399 aa  479  1e-134  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  63.59 
 
 		 403 aa  481  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  65.44 
 
 		 413 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  64.64 
 
 		 396 aa  474  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.73 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.02 
 
 		 404 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.34 
 
 		 407 aa  462  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.03 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.57 
 
 		 398 aa  454  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.61 
 
 		 407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.7 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  63.75 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.92 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.27 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.28 
 
 		 373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.78 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.34 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  48.82 
 
 		 394 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.73 
 
 		 371 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  48.03 
 
 		 394 aa  350  2e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  50.13 
 
 		 394 aa  345  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  50.66 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.42 
 
 		 375 aa  342  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  47.24 
 
 		 394 aa  339  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  47.24 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  47.24 
 
 		 394 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  53.31 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.38 
 
 		 372 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  50.57 
 
 		 365 aa  335  1e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  45.41 
 
 		 393 aa  334  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  48.7 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.01 
 
 		 371 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44 
 
 		 382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  66.39 
 
 		 239 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  47.03 
 
 		 354 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  41.81 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  56.94 
 
 		 156 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  30.92 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  29.21 
 
 		 1491 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  30.08 
 
 		 239 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1538  thiamine pyrophosphokinase  28.49 
 
 		 211 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>