51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0591 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  100 
 
 
365 aa  734    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  54.79 
 
 
373 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.7 
 
 
373 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  57.51 
 
 
373 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.46 
 
 
375 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.05 
 
 
371 aa  391  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.55 
 
 
371 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.79 
 
 
372 aa  371  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.26 
 
 
398 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.52 
 
 
413 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.69 
 
 
399 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.81 
 
 
395 aa  361  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.46 
 
 
396 aa  357  9.999999999999999e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.47 
 
 
399 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.58 
 
 
407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50 
 
 
404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  49.71 
 
 
403 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.81 
 
 
392 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  50.91 
 
 
396 aa  347  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.6 
 
 
395 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.44 
 
 
392 aa  346  5e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.17 
 
 
407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.72 
 
 
404 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.88 
 
 
382 aa  333  4e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  50.31 
 
 
389 aa  330  2e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.38 
 
 
415 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  43.71 
 
 
390 aa  292  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  40.19 
 
 
399 aa  253  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  38.15 
 
 
393 aa  250  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  39.1 
 
 
394 aa  249  6e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  38.22 
 
 
394 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  38.51 
 
 
394 aa  246  4e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  37.93 
 
 
394 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  37.93 
 
 
394 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  38.22 
 
 
394 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  55.41 
 
 
239 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.2 
 
 
390 aa  241  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  39.63 
 
 
398 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  37.95 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  33.05 
 
 
394 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  45.9 
 
 
156 aa  116  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  23.48 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  29.25 
 
 
238 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  39.29 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  26.97 
 
 
238 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  53.85 
 
 
230 aa  46.6  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  26.45 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  25.85 
 
 
238 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1147  thiamine pyrophosphokinase  56.25 
 
 
205 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.514296  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0949  thiamine pyrophosphokinase  29.13 
 
 
203 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156762  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  32.14 
 
 
239 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>