48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3007 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 		 395 aa  774    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  68.95 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  67.6 
 
 		 403 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  70.45 
 
 		 392 aa  511  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  66.67 
 
 		 399 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  69.62 
 
 		 392 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.1 
 
 		 399 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  65.13 
 
 		 404 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  66.05 
 
 		 407 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  68.1 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  73.94 
 
 		 407 aa  474  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  63.59 
 
 		 396 aa  474  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.47 
 
 		 398 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.46 
 
 		 396 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.89 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  61.88 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  54.34 
 
 		 373 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.92 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.1 
 
 		 373 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  49.87 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  51.24 
 
 		 373 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  49.87 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  50.13 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  52.85 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.2 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  49.1 
 
 		 394 aa  366  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.59 
 
 		 371 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  51.55 
 
 		 399 aa  360  2e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  48.82 
 
 		 393 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.04 
 
 		 375 aa  357  2.9999999999999997e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  51.81 
 
 		 365 aa  352  8.999999999999999e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.33 
 
 		 372 aa  339  4e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  71.13 
 
 		 239 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  53.31 
 
 		 390 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.32 
 
 		 371 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  50.13 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  50.42 
 
 		 354 aa  307  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.73 
 
 		 382 aa  290  2e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  44.27 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  65.75 
 
 		 156 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  32 
 
 		 407 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  29.05 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  27.7 
 
 		 238 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  40 
 
 		 223 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  23.9 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  38.3 
 
 		 224 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  26.35 
 
 		 238 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>