48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1310 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
371 aa  743    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  55.93 
 
 
373 aa  395  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.6 
 
 
375 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  47.83 
 
 
373 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.91 
 
 
373 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.92 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  50.55 
 
 
365 aa  361  9e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.28 
 
 
372 aa  334  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.09 
 
 
398 aa  327  3e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.06 
 
 
395 aa  322  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.49 
 
 
407 aa  319  5e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.73 
 
 
413 aa  316  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.33 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.58 
 
 
399 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  44.38 
 
 
396 aa  312  6.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  47.22 
 
 
392 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  42.36 
 
 
403 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.24 
 
 
382 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.85 
 
 
407 aa  308  9e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.93 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  43.81 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.59 
 
 
415 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  43.81 
 
 
390 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.6 
 
 
396 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.05 
 
 
404 aa  295  9e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  39.89 
 
 
404 aa  292  6e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.16 
 
 
395 aa  292  8e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.55 
 
 
390 aa  237  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  35.23 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  34.44 
 
 
394 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  34.38 
 
 
394 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  35.06 
 
 
399 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  33.63 
 
 
394 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  32.86 
 
 
393 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  52.88 
 
 
239 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  34.43 
 
 
398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  34.54 
 
 
354 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  28.07 
 
 
394 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  39.39 
 
 
156 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  40.4 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  32.17 
 
 
239 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  31.3 
 
 
242 aa  53.1  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  43.08 
 
 
238 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  34.82 
 
 
238 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  40.91 
 
 
238 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3933  thiamine pyrophosphokinase  41.82 
 
 
221 aa  42.7  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>