42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11712 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  79.7 
 
 
394 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  79.7 
 
 
394 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  81.22 
 
 
394 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  79.44 
 
 
394 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  80.71 
 
 
394 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  783    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  65.38 
 
 
399 aa  506  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  66.41 
 
 
398 aa  492  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  55.81 
 
 
394 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.41 
 
 
390 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.43 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.82 
 
 
395 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  46.45 
 
 
403 aa  346  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.89 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.34 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.68 
 
 
399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.3 
 
 
396 aa  316  5e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.41 
 
 
392 aa  309  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.39 
 
 
407 aa  308  8e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  52.81 
 
 
354 aa  308  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  46.69 
 
 
396 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.15 
 
 
392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.18 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.89 
 
 
398 aa  293  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  44.8 
 
 
404 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.78 
 
 
407 aa  289  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  44.91 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.29 
 
 
415 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  37.22 
 
 
373 aa  248  9e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  35.51 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  37.25 
 
 
373 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.39 
 
 
371 aa  240  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  38.15 
 
 
365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  40.31 
 
 
390 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  37.28 
 
 
375 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.86 
 
 
371 aa  218  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  37.69 
 
 
372 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  40.86 
 
 
394 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  45 
 
 
239 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.68 
 
 
382 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  46.09 
 
 
156 aa  124  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  39.64 
 
 
407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>