42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1343 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
404 aa  792    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  73.88 
 
 
407 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  69.8 
 
 
399 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  74.14 
 
 
395 aa  530  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  72.31 
 
 
396 aa  510  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.47 
 
 
413 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.91 
 
 
407 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  65.69 
 
 
389 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.25 
 
 
399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.89 
 
 
395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  61.83 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  58.81 
 
 
404 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.11 
 
 
398 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  60.7 
 
 
392 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  60.43 
 
 
392 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  58.18 
 
 
396 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.86 
 
 
373 aa  356  5e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.82 
 
 
373 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.93 
 
 
373 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  51.1 
 
 
375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.23 
 
 
371 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.6 
 
 
372 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  70.17 
 
 
239 aa  330  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.85 
 
 
415 aa  330  4e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  49.72 
 
 
365 aa  324  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.58 
 
 
390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  47.88 
 
 
394 aa  318  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  46.76 
 
 
394 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45 
 
 
390 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  45.41 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  46.22 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  45.14 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  45.14 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.05 
 
 
371 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  44.8 
 
 
393 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  45.07 
 
 
399 aa  290  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  45.41 
 
 
398 aa  276  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.35 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  49.34 
 
 
354 aa  269  7e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  42.16 
 
 
394 aa  229  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  51.59 
 
 
156 aa  127  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  30.4 
 
 
407 aa  92  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>