42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4071 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 		 390 aa  767    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  52.7 
 
 		 394 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.92 
 
 		 395 aa  403  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  54.38 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  51.67 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  51.67 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  51.93 
 
 		 394 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  51.67 
 
 		 394 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  51.41 
 
 		 393 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  47.94 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  51.8 
 
 		 398 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  49.74 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.21 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.45 
 
 		 399 aa  358  9.999999999999999e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.42 
 
 		 399 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.27 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  49.87 
 
 		 396 aa  355  8.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.46 
 
 		 396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.34 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.2 
 
 		 392 aa  345  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.34 
 
 		 407 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.67 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  50.71 
 
 		 354 aa  323  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.68 
 
 		 398 aa  319  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.94 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  46.87 
 
 		 389 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  39.14 
 
 		 415 aa  263  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  36.17 
 
 		 373 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  36.92 
 
 		 373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  36.1 
 
 		 373 aa  257  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.28 
 
 		 371 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  38.21 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  33.9 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  38.37 
 
 		 390 aa  238  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  37.68 
 
 		 365 aa  232  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  48.95 
 
 		 239 aa  230  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  37.56 
 
 		 394 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  35.03 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  31.05 
 
 		 382 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  47.18 
 
 		 156 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  29.75 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>