46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06600 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
371 aa  747    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  59.66 
 
 
373 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  54.25 
 
 
373 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.35 
 
 
373 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.33 
 
 
375 aa  384  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  50.72 
 
 
403 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.35 
 
 
399 aa  375  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  52.2 
 
 
365 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.17 
 
 
413 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.75 
 
 
404 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.13 
 
 
372 aa  364  2e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.92 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.76 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.37 
 
 
407 aa  355  8.999999999999999e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.47 
 
 
392 aa  351  8.999999999999999e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.18 
 
 
382 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.36 
 
 
399 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.53 
 
 
392 aa  348  9e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.22 
 
 
396 aa  346  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  48.48 
 
 
396 aa  345  6e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.3 
 
 
398 aa  345  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50 
 
 
395 aa  345  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.28 
 
 
407 aa  344  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  47.45 
 
 
389 aa  341  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.23 
 
 
404 aa  338  7e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.33 
 
 
415 aa  335  5.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.15 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  39.02 
 
 
399 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  36.04 
 
 
390 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  35.64 
 
 
394 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  36.59 
 
 
394 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  35.36 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  35.36 
 
 
394 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  36.36 
 
 
394 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  35.54 
 
 
394 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  61.58 
 
 
239 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  34.39 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  40.46 
 
 
354 aa  239  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  37.99 
 
 
398 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  31 
 
 
394 aa  176  8e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  38.58 
 
 
156 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  23.08 
 
 
407 aa  85.5  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  40.58 
 
 
223 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4124  thiamine pyrophosphokinase  30.48 
 
 
207 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.738174  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  29.22 
 
 
242 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  29.41 
 
 
239 aa  43.5  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>