48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2030 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  87.39 
 
 		 404 aa  414  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  76.47 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  73.22 
 
 		 403 aa  360  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  75.31 
 
 		 399 aa  345  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.79 
 
 		 399 aa  343  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.01 
 
 		 407 aa  335  2.9999999999999997e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.13 
 
 		 395 aa  334  7.999999999999999e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  70.17 
 
 		 404 aa  332  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.55 
 
 		 398 aa  331  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.85 
 
 		 395 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  71.43 
 
 		 407 aa  323  2e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  68.35 
 
 		 396 aa  323  2e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  67.22 
 
 		 389 aa  318  6e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.76 
 
 		 396 aa  293  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  66.39 
 
 		 392 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  66.39 
 
 		 392 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.63 
 
 		 373 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  57.4 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  57.48 
 
 		 373 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  56.54 
 
 		 373 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  52.79 
 
 		 371 aa  248  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  55.36 
 
 		 375 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  54.88 
 
 		 415 aa  229  3e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.26 
 
 		 372 aa  228  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  60.62 
 
 		 390 aa  228  5e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.95 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  47.08 
 
 		 394 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.7 
 
 		 371 aa  223  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  45.83 
 
 		 394 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.92 
 
 		 382 aa  216  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  45.83 
 
 		 394 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  46.86 
 
 		 399 aa  215  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  48.95 
 
 		 394 aa  214  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  45.42 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  45.42 
 
 		 394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  45 
 
 		 393 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  46.03 
 
 		 398 aa  200  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  45.61 
 
 		 354 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  40.08 
 
 		 394 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  43.48 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  30.87 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  29.81 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  30.56 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  62.07 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  54.29 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  29.53 
 
 		 238 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>