44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3024 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 		 404 aa  799    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  67.7 
 
 		 403 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  69.58 
 
 		 413 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  67.58 
 
 		 399 aa  518  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  65.13 
 
 		 395 aa  483  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  65.43 
 
 		 407 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.28 
 
 		 399 aa  474  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.51 
 
 		 395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  63.17 
 
 		 396 aa  467  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  63.43 
 
 		 407 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  63.32 
 
 		 389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  62.02 
 
 		 392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  61.5 
 
 		 392 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  58.81 
 
 		 404 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  61.93 
 
 		 398 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  64.41 
 
 		 396 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  87.39 
 
 		 239 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.75 
 
 		 371 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  47.99 
 
 		 373 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.74 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.86 
 
 		 373 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  47.27 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  46.75 
 
 		 394 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.27 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  46.23 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.39 
 
 		 373 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  45.97 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  45.97 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  49.21 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  45.34 
 
 		 393 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  50.7 
 
 		 375 aa  334  2e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  45.02 
 
 		 399 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  50 
 
 		 365 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  52.63 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.85 
 
 		 372 aa  326  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  46.95 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.47 
 
 		 382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  39.89 
 
 		 371 aa  292  7e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  49.67 
 
 		 354 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  40.95 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  70.32 
 
 		 156 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  31.13 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  47.73 
 
 		 223 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  62.07 
 
 		 230 aa  43.1  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>