49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0314 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  474  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  91.18 
 
 
238 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  90.76 
 
 
238 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  72.61 
 
 
239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  60.74 
 
 
242 aa  297  9e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  47.15 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  48.5 
 
 
244 aa  157  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  40.27 
 
 
207 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  36.77 
 
 
216 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  39.46 
 
 
209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  35.04 
 
 
235 aa  125  7e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  43.66 
 
 
204 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  38.59 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  34.59 
 
 
206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  32.75 
 
 
232 aa  112  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  33.86 
 
 
208 aa  105  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  36.36 
 
 
220 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  30.84 
 
 
232 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  36.99 
 
 
162 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  30.4 
 
 
232 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  31.75 
 
 
207 aa  98.6  7e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  29.86 
 
 
237 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  37.24 
 
 
221 aa  89.4  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  32.5 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  33.85 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  35.19 
 
 
206 aa  62  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  29.86 
 
 
214 aa  55.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  34.78 
 
 
431 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  34.82 
 
 
371 aa  48.9  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  29.25 
 
 
365 aa  48.9  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  28.57 
 
 
396 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  29.05 
 
 
395 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  28.92 
 
 
433 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.96 
 
 
407 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  30.87 
 
 
239 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  26.35 
 
 
415 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  29.08 
 
 
389 aa  45.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0167  motility accessory factor  28.14 
 
 
578 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000316837  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  33.85 
 
 
430 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  29.41 
 
 
399 aa  44.3  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  37.33 
 
 
441 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  32.1 
 
 
446 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  28.29 
 
 
395 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  28.86 
 
 
404 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  25 
 
 
824 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  26.99 
 
 
608 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  29.86 
 
 
635 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  31.52 
 
 
440 aa  42  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  29.17 
 
 
629 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>