46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1687 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  100 
 
 
382 aa  769    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.18 
 
 
371 aa  351  1e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  47.31 
 
 
373 aa  342  9e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.33 
 
 
373 aa  341  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  49.3 
 
 
373 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.04 
 
 
375 aa  335  7e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.79 
 
 
372 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  45.88 
 
 
365 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.24 
 
 
371 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.17 
 
 
399 aa  305  7e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.14 
 
 
396 aa  305  9.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.47 
 
 
404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  45.67 
 
 
392 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.37 
 
 
392 aa  300  4e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  41.67 
 
 
403 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.61 
 
 
413 aa  293  5e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  44.61 
 
 
396 aa  292  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  40.34 
 
 
415 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  43.15 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.94 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.1 
 
 
399 aa  282  6.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.92 
 
 
407 aa  280  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.04 
 
 
407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.34 
 
 
398 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  39.41 
 
 
390 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.37 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  43.49 
 
 
404 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  50.92 
 
 
239 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  32.63 
 
 
390 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  33.9 
 
 
394 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  34.99 
 
 
394 aa  193  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  34.68 
 
 
393 aa  193  4e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  33.33 
 
 
394 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  34.99 
 
 
394 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  34.99 
 
 
394 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  33.13 
 
 
394 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  32.93 
 
 
399 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  35.99 
 
 
354 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  33.53 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  28.38 
 
 
394 aa  144  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  21.18 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1966  thiamine pyrophosphokinase  47.73 
 
 
223 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.923392  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0879  thiamine pyrophosphokinase  35.29 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  45.61 
 
 
224 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1706  thiamine pyrophosphokinase  48.89 
 
 
209 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>