44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1452 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1452  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  100 
 
 		 390 aa  759    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.133094  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2010  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  55.21 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.113 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1127  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.64 
 
 		 399 aa  345  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22120  uncharacterized membrane-anchored protein  53.03 
 
 		 396 aa  338  9e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00627059  normal  0.779983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1914  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  53.82 
 
 		 392 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0967076  normal  0.164651 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1905  thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.82 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.028315  hitchhiker  0.000109724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3024  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.59 
 
 		 404 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.468462  normal  0.163552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2172  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.31 
 
 		 413 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000233107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3007  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.31 
 
 		 395 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1614  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  48.14 
 
 		 375 aa  335  1e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1088  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  43.56 
 
 		 373 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.626516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1547  thiamin pyrophosphokinase, catalytic region  44.79 
 
 		 373 aa  329  4e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1343  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  50.14 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2354  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  49.18 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.412725  hitchhiker  0.00636665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6055  membrane protein  50.43 
 
 		 403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0501104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13680  uncharacterized membrane-anchored protein  51.64 
 
 		 389 aa  326  3e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.250065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06600  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  42.74 
 
 		 371 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3146  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  53.37 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0465351  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2042  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.64 
 
 		 373 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.978362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4436  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  48.68 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463172  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5425  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.66 
 
 		 398 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.519507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1660  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  51.68 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.316441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3083  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  45.68 
 
 		 415 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.16768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1310  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  41.51 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1391  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  46.13 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.645709  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0591  hypothetical protein  40.55 
 
 		 365 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1687  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  37.63 
 
 		 382 aa  280  2e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.677284  hitchhiker  0.00191184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2379  hypothetical protein  44.55 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2961  hypothetical protein  41.69 
 
 		 394 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.466048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2946  hypothetical protein  41.41 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2990  hypothetical protein  41.41 
 
 		 394 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal  0.311943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3285  hypothetical protein  40.85 
 
 		 394 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3504  hypothetical protein  39.44 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.376057  normal  0.161738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4071  Thiamin pyrophosphokinase catalytic region  38.37 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.154875  normal  0.112383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5437  putative membrane-anchored protein  41.91 
 
 		 394 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11712  hypothetical protein  39.48 
 
 		 393 aa  236  6e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.296933 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2825  membrane protein  42.31 
 
 		 398 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2030  hypothetical protein  60.62 
 
 		 239 aa  229  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25440  uncharacterized membrane-anchored protein  44.77 
 
 		 354 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.498784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2483  hypothetical protein  41.18 
 
 		 394 aa  192  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471903  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2031  hypothetical protein  43.18 
 
 		 156 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1244  hypothetical protein  26.09 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.745581  normal  0.686905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3607  thiamine pyrophosphokinase  47.69 
 
 		 224 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.945813 
 
 
-
 
NC_002978  WD0480  hypothetical protein  68.97 
 
 		 230 aa  44.3  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>