27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1388 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  100 
 
 
237 aa  464  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  63 
 
 
232 aa  272  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  63.2 
 
 
232 aa  251  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  56.54 
 
 
235 aa  249  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  59.31 
 
 
232 aa  238  5e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  43.56 
 
 
206 aa  154  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  42.65 
 
 
207 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  41.35 
 
 
206 aa  148  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  44.88 
 
 
207 aa  139  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  41.41 
 
 
213 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  41.46 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  36.76 
 
 
209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  41.58 
 
 
208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  28.69 
 
 
242 aa  124  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  30.04 
 
 
238 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  32.09 
 
 
220 aa  103  2e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  30.7 
 
 
238 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  30.04 
 
 
238 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  29.31 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  32.58 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  41.79 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  38.96 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  35.21 
 
 
204 aa  72  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  38.24 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  31.03 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  30.73 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>