27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1670 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1670  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  416  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000666865 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1041  hypothetical protein  65.69 
 
 
206 aa  292  2e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.775077  hitchhiker  0.000191515 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1542  hypothetical protein  66 
 
 
201 aa  286  2e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.034899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1475  hypothetical protein  65.2 
 
 
214 aa  263  1e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.430419  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1969  hypothetical protein  38.79 
 
 
221 aa  143  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.628894 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0147  protein of unknown function DUF115  37 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922435 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0615  hypothetical protein  34.25 
 
 
206 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.835351  normal  0.116488 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0755  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.236043  normal  0.782372 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0624  hypothetical protein  35.88 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0659774  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0184  hypothetical protein  37.78 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000950206  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0398  hypothetical protein  41.53 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176265  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1388  protein of unknown function DUF115  37.78 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.228994  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  39.05 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2274  hypothetical protein  38.89 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  34.31 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0003  protein of unknown function DUF115  39.57 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.115693  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0624  hypothetical protein  33.97 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1452  hypothetical protein  33.11 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.125155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  32.41 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1845  protein of unknown function DUF115  43.88 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3612  hypothetical protein  34.23 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2645  protein of unknown function DUF115  40.43 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  32.85 
 
 
238 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  28.28 
 
 
242 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2770  protein of unknown function DUF115  36.57 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00349499  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0215  protein of unknown function DUF115  38.53 
 
 
204 aa  55.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1187  protein of unknown function DUF115  33.06 
 
 
220 aa  54.7  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>