More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1295 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1295  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 361 aa  735    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1503  secretion protein HlyD  68.98 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.289067  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4556  secretion protein HlyD family protein  58.38 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241944  normal  0.0605665 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4423  secretion protein HlyD family protein  58.38 
 
 		 361 aa  431  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.045905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7009  secretion protein HlyD family protein  59.56 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.159202  normal  0.765528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5590  secretion protein HlyD family protein  61.84 
 
 		 361 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0446  membrane protein  59 
 
 		 361 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0102  secretion protein HlyD family protein  58.84 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0100  hypothetical protein  58.84 
 
 		 361 aa  402  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0148  membrane protein  59.05 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1032  ABC-type export system, membrane fusion protein  59.05 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2624  MFP family transporter  59.05 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2767  MFP family transporter  59.33 
 
 		 361 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1319  MFP family transporter  59.05 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1224  secretion protein HlyD  61.84 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343602  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0174  MFP family transporter  58.77 
 
 		 361 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5888  secretion protein HlyD family protein  58.5 
 
 		 361 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.998521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0311  secretion protein HlyD family protein  51.81 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0146421  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0008  secretion protein HlyD family protein  52.65 
 
 		 363 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000302217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  32.85 
 
 		 414 aa  150  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0165  secretion protein HlyD family protein  31.72 
 
 		 411 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  29.09 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1810  hypothetical protein  29.69 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.516711  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2112  secretion protein HlyD family protein  29.4 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  unclonable  0.0000000135214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0963  hypothetical protein  27.2 
 
 		 307 aa  93.2  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1396  secretion protein HlyD family protein  27.37 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0504775  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1628  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.3 
 
 		 383 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3000  hypothetical protein  29.33 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  24.86 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2355  secretion protein HlyD  28 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0694634 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1382  secretion protein HlyD family protein  31.49 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.396008  hitchhiker  0.000481704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1513  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0259  secretion protein HlyD  26.01 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.689376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  26.4 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  25 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1549  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  29.33 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  23.86 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  27.31 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1522  secretion protein HlyD family protein  25.77 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2833  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121026  normal  0.828234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4203  hypothetical protein  24.72 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.99855  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0875  secretion protein HlyD family protein  27.47 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.316135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4639  multidrug resistance protein MdtN  28.21 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2115  secretion protein HlyD family protein  32.32 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.441068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0129  hypothetical protein  25.72 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.993938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3250  hypothetical protein  30.05 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3945  multidrug resistance protein MdtN  28.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03954  predicted membrane fusion protein of efflux pump  28.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4327  multidrug resistance protein MdtN  28.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3910  efflux pump membrane protein  28.21 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03914  hypothetical protein  28.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4546  multidrug resistance protein MdtN  28.21 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.49 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  27.91 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  28.43 
 
 		 470 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  28.43 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.04 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5590  multidrug resistance protein MdtN  27.69 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 		 509 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  28.43 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  21.12 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  29.02 
 
 		 343 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  28.99 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  23.57 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  31.25 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.06 
 
 		 420 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  25.65 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  25.45 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  25.45 
 
 		 328 aa  56.6  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  25.31 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.4 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1263  efflux transporter  29.38 
 
 		 415 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.471028  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  26.47 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.1 
 
 		 505 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.214189 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  28.32 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  25.25 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.63 
 
 		 496 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  27.72 
 
 		 460 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26 
 
 		 428 aa  54.7  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.79 
 
 		 504 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  29.02 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7637  efflux pump protein  31.25 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1420  secretion protein HlyD family protein  23.64 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  29.02 
 
 		 410 aa  53.1  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.13 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1532  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  26.88 
 
 		 500 aa  52.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1794  secretion protein HlyD family protein  28.32 
 
 		 350 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  28.79 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  26.83 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1204  secretion protein HlyD  31.86 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.377097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.76 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  28.35 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07032  hypothetical protein  26.76 
 
 		 349 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  28.27 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1024  secretion protein HlyD  27.84 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>